体格检查包含身高与体重可反映身体基本状况及影响男性生殖健康相关激素水平等、外生殖器检查观察阴茎发育等情况及触摸睾丸附睾等、实验室检查的精液常规可初步评估男性生育能力等情况、血液检查的性激素六项等可了解相关激素等情况、血常规可了解有无感染贫血等、肝肾功能异常可能影响男性生殖健康、影像学检查的阴囊超声可发现睾丸附睾等病变、前列腺超声可辅助诊断前列腺相关疾病、特殊检查的尿流率检查可评估排尿功能、阴茎海绵体血流多普勒超声检查可协助诊断血管性勃起功能障碍等，不同年龄男性体检重点不同，有不良生活方式或既往病史的男性需重视相应检查。
身高与体重：身高体重可反映身体基本状况，体重指数（BMI）=体重（kg）/身高（m）2，正常范围18.5~23.9，过高或过低可能与内分泌等问题相关，影响男性生殖健康相关激素水平等。
外生殖器检查：观察阴茎的发育情况，包括长度、直径、有无畸形等；检查阴囊外观，有无阴囊皮肤异常、阴囊大小是否正常，触摸睾丸的大小、质地、有无结节，附睾的情况等，睾丸正常大小约15~25ml，质地柔韧，附睾正常情况下可触摸到。
实验室检查
精液常规检查：包括精液量、精子密度、精子活力（前向运动精子百分率等）、精子形态等。精液量正常范围1.5~6ml，精子密度正常应≥15×10/ml，前向运动精子（a+b级）应≥32%，正常形态精子应≥4%。通过精液常规检查可初步评估男性生育能力等情况。
血液检查
性激素六项：包括睾酮、雌二醇、黄体生成素、卵泡刺激素、泌乳素、孕酮。睾酮对于男性生殖器官发育、精子生成等起重要作用，正常成年男性睾酮水平一般在14~25.4nmol/L；黄体生成素和卵泡刺激素参与调节睾丸的生精和雄激素分泌等功能，黄体生成素正常范围5~20U/L，卵泡刺激素正常范围1.5~12.4U/L等。
血常规：可了解有无感染、贫血等情况，感染可能影响生殖系统，贫血会影响全身供氧，包括生殖系统的供氧情况。
肝肾功能：肝肾功能异常可能影响药物代谢以及体内激素等的代谢，从而对男性生殖健康产生影响，例如某些药物代谢异常可能会影响精子生成等过程，肾功能异常可能导致体内毒素积聚影响内分泌等。
影像学检查
超声检查
阴囊超声：可清晰观察睾丸、附睾、精索静脉等情况。能发现睾丸附睾的炎症、肿瘤、精索静脉曲张等病变。精索静脉曲张超声表现为精索静脉内径增宽，平静呼吸时精索静脉内径≥2mm，valsalva试验时≥3mm。
前列腺超声：了解前列腺的大小、形态、有无结节等，正常前列腺大小约4cm×3cm×2cm，通过超声可辅助诊断前列腺炎、前列腺增生、前列腺癌等疾病。
特殊检查
尿流率检查：用于评估排尿功能，了解有无下尿路梗阻等情况。通过尿流率仪测量尿流速度等指标，正常尿流率最大尿流率≥15ml/s等。
阴茎海绵体血流多普勒超声检查：对于勃起功能障碍患者，可评估阴茎海绵体血流情况，协助诊断血管性勃起功能障碍等。
对于不同年龄的男性，体检重点略有不同。年轻男性如果有生育计划等需求，精液常规等检查更为重要；中老年男性则需更加关注前列腺相关检查以及睾酮等性激素水平检查，因为随着年龄增长，前列腺疾病发生率升高，性激素水平也可能发生变化。有不良生活方式的男性，如长期吸烟、酗酒、久坐等，应更加重视精液常规、肝功能等检查，因为这些不良生活方式可能影响生殖系统和肝肾功能。有既往病史的男性，比如有过生殖系统感染病史的，需要重点复查相关感染指标以及生殖系统结构功能情况等。
