体格检查包含外生殖器检查观察阴茎等及第二性征情况，实验室检查有精液分析查精液量等、血液检查含性激素及其他生化检查，影像学检查有阴囊超声、前列腺超声及CT或MRI等，特殊检查有尿流率检查评估排尿功能、阴茎海绵体血流多普勒检查助勃起功能障碍诊断。
外生殖器检查：观察阴茎的大小、形态，有无畸形、硬结、损伤等；检查阴囊的大小、对称性，睾丸的位置、大小、质地，附睾是否有结节、肿大等情况。不同年龄男性外生殖器发育情况不同，儿童期需关注是否有发育异常迹象，成年男性则重点排查病理改变。例如，睾丸正常大小一般为12-25ml左右，质地应柔软均匀。
第二性征检查：查看胡须、阴毛、腋毛的分布情况，乳房发育是否正常等。这对于判断男性内分泌功能等有重要意义，比如雄激素缺乏可能导致第二性征不明显等情况。
实验室检查
精液分析：是男科常见且重要的检查项目。需要男性通过手淫的方式采集精液，检查内容包括精液量、精子密度、精子活力（前向运动精子百分率等）、精子形态等。不同年龄阶段男性精液参数有一定差异，一般来说，正常精液量应在1.5ml以上，精子密度≥15×10/ml，前向运动精子（a级+b级）≥32%，正常形态精子≥4%。精液分析可评估男性生育能力等情况，对于不育症的诊断等有关键作用。
血液检查
性激素检查：包括睾酮、黄体生成素（LH）、卵泡刺激素（FSH）等。性激素水平异常可能导致性功能障碍、不育等问题。不同年龄段性激素水平有波动，儿童期性激素水平较低，青春期后逐渐升高并维持相对稳定水平。例如，成年男性睾酮正常范围一般在12-35nmol/L左右，LH正常范围在1.24-8.62U/L，FSH正常范围在1.27-19.26U/L。通过性激素检查可辅助诊断内分泌相关的男科疾病，如睾酮水平降低可能与勃起功能障碍等相关。
其他血液生化检查：如肝肾功能、血糖、血脂等检查。肝肾功能异常可能影响药物代谢等情况，血糖血脂异常也可能与男科疾病有一定关联，比如糖尿病可能引起勃起功能障碍等并发症。
影像学检查
超声检查
阴囊超声：可清晰观察睾丸、附睾、精索静脉等情况。对于睾丸扭转、附睾炎、精索静脉曲张等疾病的诊断有重要价值。例如，精索静脉曲张超声表现为精索静脉内径增宽，平静呼吸时静脉内径≥2mm，valsalva试验时≥3mm等。不同年龄男性阴囊超声表现会因发育等情况有所不同，儿童期睾丸等结构相对较小，检查时需注意手法轻柔。
前列腺超声：能检查前列腺的大小、形态、结构等，对于前列腺增生、前列腺癌等疾病的诊断有帮助。正常前列腺大小约4cm×3cm×2cm左右，通过超声可观察前列腺内部回声等情况，协助判断是否存在病变。
CT或MRI检查：对于一些复杂的男科疾病，如盆腔内肿瘤等情况，CT或MRI检查可提供更详细的解剖结构信息，帮助明确病变范围等，但一般是在其他检查初步怀疑有较严重病变时进一步选用。
特殊检查
尿流率检查：用于评估排尿功能，通过测定尿流率曲线来判断尿道阻力、膀胱逼尿肌功能等情况。对于前列腺增生等引起的排尿困难等问题有诊断价值，不同年龄男性尿流率有差异，一般成年男性最大尿流率应≥15ml/s。
阴茎海绵体血流多普勒检查：主要用于勃起功能障碍的诊断，通过检测阴茎海绵体血流情况，判断是否存在血管性勃起功能障碍等。例如，可观察阴茎动脉的血流速度、血流峰值等指标，帮助分析勃起功能障碍的原因。
