HPV与HIV在传播途径上有性传播的共性，母婴传播情况不同；HIV破坏免疫系统影响HPV感染结局，HPV感染可能影响HIV感染进程；两者共同增加癌症发生风险，且在疾病筛查和防治中有协同性，临床对同时怀疑两者感染的患者需联合筛查和综合防治，对已感染其中一种病毒的患者要关注另一种病毒感染状况以全面评估健康并制定方案
性传播的共性：两者都可通过性接触传播。在无保护的性行为过程中，HPV主要通过皮肤-皮肤、黏膜-黏膜的接触进行传播，而HIV主要存在于感染者的血液、精液、阴道分泌物等体液中，可通过性接触时的黏膜破损等途径侵入人体。例如，有多个性伴侣的人群，同时感染HPV和HIV的风险都会增加，因为性传播是这两种病毒扩散的重要方式之一，不同性伴侣间的病毒接触机会增多。
母婴传播的情况：HPV一般不会通过母婴传播给胎儿，但HIV可通过母婴传播，如感染HIV的母亲在怀孕、分娩或哺乳过程中，可能将病毒传给胎儿或婴儿。不过这是两种病毒在母婴传播上的不同表现，HPV主要不是以母婴传播为主要的传播关联方式，而HIV存在明确的母婴传播途径。
对免疫系统影响的关联
HIV对免疫系统的破坏影响HPV感染结局：HIV会破坏人体的免疫系统，尤其是CD4+T淋巴细胞。当人体感染HIV后，免疫系统功能下降，对于HPV的清除能力减弱。正常情况下，人体免疫系统可以在一定程度上控制HPV的感染，使多数HPV感染为一过性且可自行清除，但HIV感染者由于免疫功能受损，更容易发生持续的HPV感染，进而增加了发展为高级别宫颈病变甚至宫颈癌的风险。例如，研究发现HIV阳性的女性，HPV持续感染的概率比HIV阴性女性高很多，这是因为HIV破坏了免疫系统对HPV的监视和清除机制。
HPV感染对HIV感染进程的影响：某些高危型HPV感染可能会影响HIV感染的进程。有研究表明，HPV感染可能会导致生殖道黏膜的炎症反应，这种炎症环境可能会促进HIV的传播和复制。同时，HPV相关的病变可能会影响抗HIV治疗的效果，因为病变部位的局部环境变化可能不利于抗HIV药物发挥作用。
疾病发生风险的关联
共同增加癌症发生风险：HPV持续感染是导致宫颈癌等多种癌症的重要因素，而HIV感染患者由于免疫功能低下，发生其他癌症的风险也会增加，同时HIV感染合并HPV感染时，患相关癌症的风险进一步升高。例如，HIV阳性且感染高危型HPV的女性，患宫颈癌的风险远高于单纯HPV感染或单纯HIV感染的人群。而且，两种病毒感染都可能通过影响机体的免疫监视功能，使得身体对异常细胞的识别和清除能力下降，从而为癌症的发生创造条件。
在疾病筛查和防治中的协同性：由于两者存在上述关联，在临床诊疗中，对于同时怀疑HPV和HIV感染的患者，需要进行联合筛查和综合防治。例如，在对有性行为的人群进行健康检查时，应同时考虑HPV和HIV的检测，以便早期发现感染情况并采取相应的干预措施。对于已经感染其中一种病毒的患者，要密切关注另一种病毒的感染状况，因为两者相互影响疾病的发展和预后。比如，对于HIV感染患者，要定期进行HPV相关的宫颈癌筛查，而对于HPV感染患者，也要进行HIV检测，以全面评估患者的健康状况，制定合理的治疗和随访方案。
