乙型脑炎和流脑的症状区别有发病诱因不同、初期症状不同、神经系统症状不同、伴随症状不同等。
1.发病诱因不同
乙型脑炎是由乙型脑炎病毒感染引起的，主要通过蚊虫叮咬传播，发病具有明显的季节性，多在夏秋季流行。流脑是由脑膜炎双球菌感染引起的，主要通过呼吸道飞沫传播，发病多在冬春季，儿童和青少年为高发人群。
2.初期症状不同
乙型脑炎初期症状以发热、头痛、恶心、呕吐为主，体温多呈持续性升高，可达39℃以上，还可能伴随嗜睡、乏力等精神不振的表现，初期症状相对缓和，病程进展较慢。流脑初期症状为突发高热、寒战、头痛剧烈，体温上升速度快，短时间内可达40℃，病情进展迅速。
3.神经系统症状不同
乙型脑炎的神经系统症状多在发病后3-5天出现，表现为意识障碍、抽搐、肢体瘫痪等，严重时会出现昏迷，部分患者会遗留智力障碍、肢体偏瘫等后遗症。流脑的神经系统症状出现较早，表现为剧烈头痛、喷射性呕吐、颈项强直等脑膜刺激征，严重时会出现休克、脑疝。
4.伴随症状不同
乙型脑炎患者常伴随全身酸痛、食欲减退等症状，部分患者会出现呼吸衰竭，这是导致死亡的主要原因。流脑患者在发病初期可能出现皮肤黏膜瘀点瘀斑，这是流脑的特征性表现，瘀点瘀斑会逐渐扩大融合，严重时会出现弥散性血管内凝血。
