简单肛瘘切除术的步骤为体位摆放、消毒铺巾、寻找内口、切开瘘管、处理瘘管及创面、缝合创面（视情况而定）。
1.体位摆放
患者取截石位，臀部略抬高，便于手术操作。
2.消毒铺巾
用碘伏等消毒剂对肛门及周围皮肤进行消毒，范围要足够广泛，一般要包括会阴部及臀部周围皮肤，然后铺无菌巾单，建立无菌操作区域。
3.寻找内口
可通过肛门指诊结合探针检查来寻找内口。将探针从外口插入，顺着瘘管走行寻找内口，同时可结合亚甲蓝染色等方法辅助寻找内口，以确保准确找到内口位置。
4.切开瘘管
沿瘘管表面做梭形切口，将瘘管周围的皮肤及皮下组织切开，逐渐向深部分离，直至将整个瘘管完全切开。在分离过程中要注意保护括约肌等重要结构，对于儿童患者，括约肌相对娇嫩，更要轻柔操作，避免过度损伤括约肌影响肛门功能。
5.处理瘘管及创面
将瘘管全部切除后，对创面进行止血处理，可采用压迫止血或电凝止血等方法。然后修剪创面边缘的皮肤，使创面呈底小口大的形状，利于创面引流及愈合。
6.缝合创面（视情况而定）
如果创面较小且污染较轻，可考虑缝合创面，以促进愈合；若创面较大或污染较重，则不缝合，让其开放引流。对于儿童患者，尽量避免缝合，以防影响肛门发育及功能。
患者术后要保持肛门局部清洁，定期进行伤口换药，一般术后1-2天换药1次，观察伤口愈合情况，有无渗血、渗液及感染等情况。换药时要注意操作轻柔，避免损伤新生的组织。
