性早熟对儿童有多方面不利影响，包括使最终身高比正常儿童矮；导致心理行为问题，如自卑焦虑等；增加肿瘤和代谢性疾病风险；还会影响生殖系统发育及生育功能，青春前期发病及女孩受影响更突出。
一、对最终身高的影响
性早熟患儿由于性激素提前大量分泌，会使骨骼生长加速，导致骨龄提前增长。在早期可能会出现身高高于同龄人的情况，但由于骨骺会过早闭合，最终身高往往比正常儿童矮。例如，有研究表明，特发性中枢性性早熟患儿如果不进行干预，成年后的身高较正常人群平均减少约5-15厘米。这与性早熟导致骨骺线过早闭合，限制了骨骼的纵向生长有关，不同病因导致的性早熟对最终身高的影响程度可能有所差异，但总体都会对最终身高产生不利影响，尤其在青春前期发病的性早熟患儿受影响更为明显。
二、心理行为问题
性早熟会使儿童在生理上提前出现第二性征，如女孩乳房发育、月经初潮提前，男孩出现阴茎增粗、变声等，这与同龄人在生理发育上的差异可能会让患儿产生自卑、焦虑、孤独等心理问题。比如，一些女孩因为月经初潮过早，在学校中可能会因为身体的变化而感到尴尬、不安，进而影响其社交行为和学习情绪。长期的心理压力可能会导致患儿出现抑郁倾向，影响其正常的心理发展和社会适应能力，这种心理行为问题在青春期前期发病的性早熟儿童中更为突出，而且女孩相对男孩可能更容易受到心理行为问题的困扰，因为女性在身体形象方面往往更为敏感。
三、增加相关疾病风险
1.肿瘤风险：部分性早熟可能是由颅内肿瘤等器质性病变引起的，如下丘脑错构瘤等，这些原发病本身会对身体造成危害，如压迫周围脑组织，引起头痛、呕吐、视力障碍等神经系统症状。同时，性早熟患儿长期处于性激素水平异常的状态下，也可能增加某些肿瘤的发病风险，虽然这种风险相对较低，但也不容忽视。例如，有研究发现，性早熟女孩患乳腺癌的潜在风险可能会有所增加，不过具体机制还在进一步研究中。
2.代谢性疾病风险：性早熟可能会影响患儿的糖代谢、脂代谢等。有研究显示，性早熟患儿发生胰岛素抵抗的概率较正常儿童升高，长期的胰岛素抵抗可能会逐渐发展为2型糖尿病。此外，性早熟还可能导致血脂代谢异常，增加动脉粥样硬化等心血管疾病的前期风险。这与性激素对体内代谢通路的调节作用有关，性早熟时性激素水平的紊乱干扰了正常的代谢平衡，尤其是在肥胖的性早熟儿童中，这种代谢异常的风险可能会进一步升高，因为肥胖本身就与代谢紊乱密切相关，而性早熟和肥胖常常相互影响，形成恶性循环。
四、对生殖系统发育及生育功能的影响
对于女孩来说，过早出现月经初潮，其生殖系统虽然开始发育，但尚未完全成熟，长期处于性激素刺激下可能会增加未来患妇科疾病的风险，如子宫内膜增生、卵巢囊肿等。而且，由于骨骺过早闭合，身体停止生长较早，可能会影响未来的生育情况，例如子宫和卵巢的发育可能受到一定限制，影响正常的受孕过程。对于男孩，性早熟可能会导致睾丸等生殖器官的发育提前，但随后可能会因为睾丸功能异常等问题影响精子的生成和质量，从而对生育功能产生不利影响。无论是男孩还是女孩，性早熟都会打乱正常的生殖系统发育节奏，对未来的生殖健康埋下隐患，这种影响在性发育启动年龄过早的患儿中表现得更为明显。
