一过性意识丧失的原因多样，有心源性（心律失常、心脏瓣膜病、先天性心脏病等）、脑源性（短暂性脑缺血发作、癫痫发作等）、血管迷走性（常见于年轻人，诱因下迷走神经兴奋致脑供血不足）、代谢性（低血糖、低氧血症等）及其他（直立性低血压、换气过度综合征等）。
心脏瓣膜病：如重度主动脉瓣狭窄，主动脉瓣口狭窄，左心室射血受阻，心输出量减少，脑供血不足，可在活动等情况下出现一过性意识丧失，这类患者多有长期瓣膜病变病史，年龄方面无特定限制但多见于有瓣膜病变进展的人群。
先天性心脏病：某些先天性心脏病，如法洛四联症，由于存在右向左分流，导致动脉血氧饱和度下降，脑缺氧，可引起一过性意识丧失，常见于儿童，是先天性心脏结构异常导致。
脑源性原因
短暂性脑缺血发作（TIA）：是由于脑血管病变引起的一过性脑供血不足，导致相应神经功能缺损症状。颈动脉系统TIA可表现为单侧肢体无力、麻木、单眼黑矇等，椎-基底动脉系统TIA可出现眩晕、复视、吞咽困难、共济失调等，进而可能出现一过性意识丧失，中老年人多见，常与动脉粥样硬化、血管狭窄等因素相关。
癫痫发作：部分癫痫发作类型可表现为一过性意识丧失，如全面性失神发作，多见于儿童和青少年，典型表现为突然发生和突然终止的意识丧失，正在进行的活动中断，双眼凝视，呼之不应等，发作间期脑电图可发现异常放电。
血管迷走性原因
常见于年轻人：多在情绪紧张、疼痛、长时间站立、空腹等情况下诱发。当这些诱因刺激时，人体会出现迷走神经兴奋，导致心脏抑制（心率减慢、心肌收缩力减弱）和外周血管扩张，使回心血量减少，心输出量降低，脑供血不足，从而引起一过性意识丧失，一般发作前可有头晕、恶心、面色苍白等前驱症状。
代谢性原因
低血糖：多见于糖尿病患者，尤其是应用胰岛素或口服降糖药不当的患者，在空腹、运动量过大或未按时进餐等情况下，血糖迅速下降，低于2.8mmol/L时可出现交感神经兴奋症状（如心悸、手抖、出汗等）和脑功能障碍症状（如意识模糊、一过性意识丧失等），儿童糖尿病患者若发生低血糖也可能出现类似表现。
低氧血症：各种原因引起的血氧含量降低都可能导致一过性意识丧失，如慢性阻塞性肺疾病急性加重期，患者肺通气和换气功能障碍，血氧分压下降；高山地区缺氧环境下，人体血氧供应不足，都可能出现脑缺氧而导致意识丧失，老年人及有肺部基础疾病者更易发生。
其他原因
直立性低血压：多见于老年人、长期卧床后突然站立或服用某些降压药等情况。当从卧位或坐位突然站起时，血压迅速下降，脑灌注不足，引起一过性意识丧失，患者可伴有头晕、视物模糊等表现。
换气过度综合征：多见于情绪激动的人群，如焦虑、紧张时，过度通气导致二氧化碳排出过多，引起呼吸性碱中毒，出现手足麻木、口周麻木、头晕、一过性意识丧失等症状。
