萎缩性胃炎的发生与多种因素有关，包括幽门螺杆菌感染（其凭借特殊结构附着胃黏膜上皮细胞，释放酶和毒素致胃黏膜腺体萎缩，且儿童感染多具家庭聚集性）、不良饮食习惯（长期高盐、过烫饮食及大量饮酒损伤胃黏膜）、自身免疫因素（体内抗体攻击胃壁细胞等致胃腺体萎缩，女性相对多见且可能有家族遗传倾向）、年龄因素（老年人胃黏膜生理性退行性变化致患病率高）及其他因素（长期服非甾体类抗炎药破坏胃黏膜屏障、胆汁反流破坏胃黏膜屏障致胃黏膜萎缩）。
不良饮食习惯
1.长期高盐饮食：高盐饮食会损伤胃黏膜的屏障功能。高浓度的盐会直接刺激胃黏膜，使胃黏膜发生充血、水肿等炎症反应，长期如此，会影响胃黏膜的正常修复和代谢，增加萎缩性胃炎的发生风险。比如长期食用腌制食品（如咸菜、咸鱼等）的人群，患萎缩性胃炎的几率相对较高。不同年龄段人群均可能因长期高盐饮食受影响，儿童若长期摄入高盐食物，也会对尚未发育完善的胃黏膜造成不良影响。
2.长期进食过烫食物：过烫的食物会烫伤胃黏膜，导致胃黏膜反复损伤和修复。胃黏膜在不断的损伤-修复过程中，容易出现细胞的异常增殖，进而增加萎缩性胃炎的发生概率。老年人由于味觉减退等原因，可能更倾向于食用较烫的食物，这会增加老年人患萎缩性胃炎的风险；儿童若经常进食过烫的食物，也会对其胃黏膜造成损害。
3.长期大量饮酒：酒精会直接刺激胃黏膜，引起胃黏膜的充血、水肿、糜烂等。乙醇在胃内代谢产生的乙醛具有毒性，会损伤胃黏膜上皮细胞，影响胃黏膜的血液供应和黏液分泌，长期大量饮酒可导致胃黏膜萎缩。男性相对女性可能更易有长期大量饮酒的情况，从而增加男性患萎缩性胃炎的风险，老年人长期大量饮酒对胃黏膜的损伤也更为严重。
自身免疫因素
自身免疫性萎缩性胃炎多见于自身免疫功能紊乱的人群。患者体内会产生针对胃壁细胞的抗体（如壁细胞抗体PCA）和内因子抗体（IFA）。壁细胞抗体攻击胃壁细胞，导致壁细胞数量减少，影响胃酸分泌；内因子抗体影响内因子的功能，内因子是参与维生素B吸收的重要物质，内因子缺乏会导致维生素B吸收不良，进而可引起恶性贫血等并发症，同时自身免疫反应持续损伤胃黏膜，导致胃腺体萎缩。自身免疫因素导致的萎缩性胃炎在女性中相对较多见，且可能有家族遗传倾向，有自身免疫性疾病家族史的人群需格外关注。
年龄因素
随着年龄的增长，胃黏膜也会出现生理性的退行性变化。老年人胃黏膜的血流减少，胃黏膜的屏障功能减退，细胞更新速度减慢，胃腺体逐渐萎缩，所以老年人患萎缩性胃炎的几率相对较高。例如，50岁以上的人群中，萎缩性胃炎的患病率明显高于年轻人。
其他因素
1.长期服用非甾体类抗炎药（NSAIDs）：如阿司匹林、布洛芬等NSAIDs药物，它们会抑制环氧合酶（COX）的活性，减少前列腺素的合成，而前列腺素对胃黏膜有保护作用，其减少会导致胃黏膜的保护屏障受损，胃黏膜容易发生炎症、糜烂甚至萎缩。长期服用NSAIDs的患者，无论年龄、性别，都可能增加患萎缩性胃炎的风险，特别是有基础疾病需要长期服用此类药物的人群，更要密切关注胃黏膜情况。
2.胆汁反流：十二指肠内容物反流至胃内，胆汁中的胆盐等成分会破坏胃黏膜的屏障功能，引起胃黏膜的炎症反应，长期的胆汁反流会导致胃黏膜萎缩。比如患有胆道疾病、胃-幽门-十二指肠运动功能失调等疾病的人群，容易出现胆汁反流，进而增加萎缩性胃炎的发生风险，不同年龄段人群均可因胆汁反流引发萎缩性胃炎。
