毛囊性丘疹的治疗包括一般治疗、药物治疗、物理治疗及针对不同病因的治疗。一般治疗需保持皮肤清洁、避免刺激；药物治疗有外用抗生素类、维A酸类及系统药物；物理治疗可采用光疗；针对不同病因如痤疮、毛发红糠疹、小棘苔藓等分别进行相应治疗，各治疗需考虑不同人群特点及病情差异。
避免刺激：避免搔抓、摩擦毛囊性丘疹部位，防止引起感染或加重皮损。不同年龄人群搔抓习惯不同，儿童可能因皮肤瘙痒不自觉搔抓，需家长多加看护引导；成年人要注意克制，避免因搔抓导致病情恶化。
药物治疗
外用药物
抗生素类：如果毛囊性丘疹是由细菌感染引起，可使用抗生素类外用药，如莫匹罗星软膏等。对于婴幼儿等特殊人群，使用时要格外谨慎，严格遵循医生指导，因为婴幼儿皮肤吸收药物能力与成人不同，需关注药物可能带来的局部刺激等反应。
维A酸类：对于毛囊口角化异常导致的毛囊性丘疹，维A酸类药物可能有效，如维A酸乳膏。但孕妇、哺乳期妇女等特殊人群使用需特别谨慎，维A酸可能对胎儿或婴儿产生不良影响，使用前应咨询医生。
系统药物治疗：如果病情较严重，可能需要系统使用药物，如细菌感染严重时可能需要口服抗生素，但要根据具体病情和个体情况由医生权衡使用，考虑年龄、基础疾病等因素。例如儿童使用抗生素需考虑其肝肾功能发育情况，选择合适的药物及剂量。
物理治疗
光疗：某些类型的毛囊性丘疹可采用光疗，如窄谱中波紫外线（NB-UVB）治疗。光疗需在专业医疗机构进行，根据患者的皮肤类型、病情严重程度等确定合适的光疗剂量和疗程。对于儿童进行光疗时，要严格控制照射剂量，因为儿童皮肤对光的耐受和反应与成人不同，避免过度照射对皮肤造成损伤。
针对不同病因的治疗
痤疮引起的毛囊性丘疹：痤疮相关毛囊性丘疹治疗除上述一般、药物、物理治疗外，还需注意生活方式调整，如避免高糖、高脂饮食，对于青春期患者，要关注其心理状态，因为痤疮可能对青少年心理产生影响。
毛发红糠疹引起的毛囊性丘疹：治疗毛发红糠疹相关毛囊性丘疹时，要根据病情严重程度选择治疗方案，可能涉及外用药物联合系统药物等，同时要注意患者的营养状况，因为毛发红糠疹可能影响营养吸收，需保证患者摄入足够的维生素等营养物质。
小棘苔藓引起的毛囊性丘疹：小棘苔藓导致的毛囊性丘疹治疗相对较简单，可采用外用药物改善症状，在治疗过程中要观察患者皮肤对药物的反应，特别是儿童患者，要注意药物使用后的局部皮肤变化。
