儿童腹部淋巴结肿大的原因包括感染因素和非感染因素。感染因素有病毒感染（如柯萨奇B病毒等，小儿易感染）和细菌感染（如链球菌、葡萄球菌等，不注意卫生易致）；非感染因素有免疫性疾病（如幼年特发性关节炎可累及）、饮食因素（长期不规律等致营养不均衡）、先天性因素（罕见的先天性淋巴结发育异常）、病史影响（腹部手术史等致局部粘连波及）。
常见病毒：如柯萨奇B病毒等较为常见。儿童机体免疫力相对较低，在病毒流行季节或接触到病毒携带者后易感染。例如，在肠道病毒流行时，病毒可经口进入人体，先在肠道局部繁殖，随后进入血液循环，到达肠系膜淋巴结引起肿大。有研究显示，在因腹部淋巴结肿大就诊的儿童中，约有一定比例是由病毒感染引发，病毒感染导致的肠系膜淋巴结炎在小儿中较为多见。
年龄因素：小儿各个年龄段都可能发生病毒感染相关的腹部淋巴结肿大，婴幼儿免疫系统发育尚不完善，相对更易受病毒侵袭。
细菌感染：
常见细菌：像链球菌、葡萄球菌等细菌感染可引发腹部淋巴结肿大。例如，呼吸道链球菌感染后，细菌可通过淋巴循环累及肠系膜淋巴结。儿童若有呼吸道感染未及时控制，细菌蔓延至肠系膜淋巴结，导致淋巴结炎症性肿大。
生活方式：不注意个人卫生，接触细菌污染的物品后未及时洗手等生活方式，增加了细菌感染的风险，尤其在集体生活的儿童中，交叉感染的几率较高。
非感染因素
免疫性疾病：
例如幼年特发性关节炎：该病可累及肠系膜淋巴结，导致淋巴结肿大。其发病机制与自身免疫紊乱有关，儿童免疫系统异常激活，攻击自身组织器官，包括肠系膜淋巴结。在幼年特发性关节炎患儿中，可出现腹部淋巴结肿大的表现，且病情活动时淋巴结肿大可能更为明显。
性别差异：目前虽无明确证据表明性别对免疫性疾病导致的腹部淋巴结肿大有显著差异，但不同性别儿童在疾病易感性上可能因自身免疫调节机制的细微不同存在一定差异，但总体来说不是主要的区分因素。
其他因素：
饮食因素：长期饮食不规律、挑食、偏食等，可导致儿童营养不均衡，影响机体的免疫功能和正常生理代谢，可能间接与腹部淋巴结肿大有关。例如，缺乏某些维生素和矿物质时，机体的防御能力下降，更容易受到各种致病因素的影响，虽然不是直接导致淋巴结肿大的原因，但会影响整体健康状况，可能使儿童更易出现淋巴结相关的异常。
先天性因素：极少数儿童可能存在先天性的淋巴结发育异常等情况，导致腹部淋巴结肿大，但这种情况相对较为罕见。例如先天性淋巴结结构异常，从胚胎发育时期就存在淋巴结的形态或功能异常，出生后表现为腹部淋巴结肿大。
病史影响：如果儿童既往有腹部手术史等，可能因术后局部组织粘连等情况影响淋巴结的正常回流等，进而导致淋巴结肿大。比如腹部手术后，局部的炎症反应或粘连可能波及肠系膜淋巴结，引起其肿大。
