病毒性脑膜炎多数患者经规范治疗后可完全康复，但病情严重程度、治疗时机及个体免疫状态会影响预后，及时干预是改善结局的关键。
病毒性脑膜炎治疗以早期干预和综合支持为核心。需动态监测颅内压、体温及意识状态，对症使用甘露醇控制颅内高压、布洛芬缓解发热；同时重视维持水电解质平衡，必要时给予营养支持，预防癫痫发作等并发症。免疫功能正常的轻症患者可门诊观察，若出现高热不退、意识模糊或颅内压持续升高，需立即住院治疗并结合病原学检测选择抗病毒药物（如阿昔洛韦或更昔洛韦）。
抗病毒药物是核心治疗手段，临床常用药物包括阿昔洛韦（适用于单纯疱疹病毒感染）、更昔洛韦（适用于巨细胞病毒等）。对肠道病毒感染（约占病毒性脑膜炎的70%），目前尚无特效抗病毒药物，以对症支持治疗为主。药物选择需结合病毒类型及患者免疫状态，轻症患者可口服，重症患者多需静脉输注，具体方案由医生根据病情调整。
预后受多重因素影响：儿童及免疫功能正常的成人患者多数病程1 - 2周，可完全康复；新生儿、老年人及免疫缺陷者（如HIV感染者、肿瘤放化疗患者）因免疫功能差，易遗留听力障碍、认知功能下降等后遗症；病毒类型差异显著影响恢复程度，单纯疱疹病毒1型感染若未及时治疗，约30%患者会出现永久性脑损伤，而肠道病毒所致脑膜炎预后相对良好。
特殊人群需重点关注：新生儿和婴幼儿需密切监测体温、血糖及电解质，积极预防脱水及惊厥；老年人需优先选择肾毒性较低的抗病毒方案，避免药物蓄积；免疫功能低下者需长期随访病毒载量，必要时联合免疫增强治疗以降低复发风险。
预防措施包括：日常注意个人卫生，勤洗手、避免接触呼吸道分泌物及污染水源；针对流感病毒、乙脑病毒等接种相应疫苗可降低感染风险；免疫功能低下者应加强营养、规律作息，必要时接种肺炎球菌疫苗减少继发感染。
