HPV感染根据感染部位和类型不同有不同症状，皮肤低危型包括寻常疣、跖疣、扁平疣；皮肤高危型有鲍温样丘疹病、鳞状细胞癌；黏膜低危型有生殖器疣（尖锐湿疣）；黏膜高危型有宫颈癌，不同人群感染后症状因个体差异、免疫状态等有别，女性孕期也可能有变化。
一、皮肤低危型HPV感染症状
1.寻常疣
多见于儿童及青少年。表现为黄豆大小或更大的灰褐色、棕色或皮色丘疹，表面粗糙，质地坚硬，可呈乳头瘤状增生。好发于手部，如手指、手背等部位，外伤或水中浸泡是常见诱因，免疫功能低下者更易发生。
2.跖疣
发生于足底，由于压迫、摩擦等原因，表现为黄豆大小的角质性丘疹，表面粗糙，界限清楚，周围绕以稍高的角质环，去除角质层后，其下方有疏松的角质软芯，可见毛细血管破裂出血而形成的小黑点，走路时可有疼痛。
3.扁平疣
好发于青少年的颜面、手背及前臂。表现为米粒至黄豆大小的扁平隆起性丘疹，圆形或椭圆形，表面光滑，质硬，正常肤色或淡褐色，多骤然出现，数目较多且密集。搔抓后可呈串珠状排列（同形反应）。
二、皮肤高危型HPV感染症状
1.鲍温样丘疹病
多见于中青年，好发于腹股沟、外生殖器及肛周等部位。表现为多个或单个色素性丘疹，大小不等，呈圆形、椭圆形或不规则形，直径2-10mm，可呈棕红、褐黑或黑色，丘疹表面可光滑或呈天鹅绒样外观，也可呈轻度角化呈疣状。
2.鳞状细胞癌
多发生于长期慢性溃疡、窦道、烧伤瘢痕等部位。开始为浸润性小斑块、结节或疣状病灶，逐渐增大，可形成溃疡，伴有恶臭，边缘隆起，质硬，易出血。多见于中老年人，有长期HPV感染史及皮肤损伤等病史者风险更高。
三、黏膜低危型HPV感染症状
1.生殖器疣（尖锐湿疣）
多见于性活跃的青、中年。好发于生殖器及肛门周围皮肤黏膜湿润区。初起为单个或多个淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等形态。患者多无明显自觉症状，少数可有异物感、灼痛、刺痒或性交不适。女性好发于大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛周等；男性多见于龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎部、会阴及肛周等。
四、黏膜高危型HPV感染症状
1.宫颈癌
早期常无明显症状和体征，随着病情进展，可出现阴道流血，早期多为接触性出血，中晚期为不规则阴道流血；阴道排液，多数患者有白色或血性、稀薄如水样或米泔状、有腥臭味的阴道排液；晚期根据癌灶累及范围出现不同的继发性症状，如尿频、尿急、便秘、下肢肿痛等；严重时可出现贫血、恶病质等全身衰竭症状。多见于有性生活史的女性，尤其是性生活过早、多个性伴侣、多孕多产等高危因素者。
不同人群感染HPV后的症状表现可能因个体差异、免疫状态等有所不同。例如，免疫功能正常的年轻人感染低危型HPV后，部分可能在一段时间后自行清除病毒，症状不明显或较轻微；而免疫功能低下者（如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者）感染HPV后，症状可能更严重且不易清除。女性在孕期由于激素水平变化等因素，HPV感染相关症状可能会有一定变化，需密切关注。
