引起流产的原因包括胚胎因素、母体全身性疾病、内分泌异常、生殖器官异常、父亲因素等。
1.胚胎因素
胚胎染色体异常是早期流产常见的原因，约占50%-60%，包括染色体数目异常和结构异常，染色体异常会导致胚胎发育停滞，从而引发流产。
2.母体全身性疾病
严重感染时病原体毒素或炎症介质可刺激子宫收缩，高热可使胚胎死亡，如孕妇患严重肺炎、败血症等疾病，可能增加流产风险；另外，患有慢性疾病如严重贫血、心力衰竭等，会导致胎盘供血不足，影响胚胎发育，增加流产几率。
3.内分泌异常
黄体分泌的孕酮不足，不能维持子宫内膜蜕膜化，影响胚胎种植和发育，约占习惯性流产的30%-40%；甲状腺激素分泌不足，会影响胚胎的生长发育，导致流产风险升高；未控制好的糖尿病，高血糖环境会影响胚胎发育，增加流产发生的可能性。
4.生殖器官异常
如纵隔子宫、双角子宫等，子宫形态异常影响胚胎着床和发育空间，增加流产风险；宫腔粘连导致宫腔容积减小，不利于胚胎种植和生长，易引发流产；妊娠中晚期，宫颈不能维持正常形态和张力，导致胎膜早破而发生流产。
5.父亲因素
精子染色体异常可使胚胎染色体异常，从而导致胚胎发育异常进而引发流产，研究表明精子染色体畸形率过高时，流产发生率会升高。
