小腿后骨头疼的原因多样，包括运动因素、拉伤、跟腱炎、跟腱损伤和胫骨应力性骨折等。
1.运动因素
如果近期有剧烈运动，比如长跑、跳绳等，小腿三头肌（包括腓肠肌和比目鱼肌）可能会因为过度使用而出现劳损。运动时肌肉反复收缩，会产生微小损伤，积累后就会导致疼痛。例如，长时间没有运动的人突然增加运动量，腓肠肌容易出现酸痛。
2.拉伤
在运动过程中，小腿三头肌可能会发生拉伤，多是由于肌肉突然的强力收缩或过度伸展引起。比如在篮球运动中快速变向时，就可能导致肌肉拉伤，出现小腿后骨头周围的疼痛，同时可能伴有肿胀、淤血等表现。
3.跟腱炎
长期的跑跳等运动，或者运动姿势不当，都可能引发跟腱炎。跟腱是连接小腿肌肉和跟骨的肌腱，反复的牵拉刺激会导致跟腱发生炎症反应，表现为小腿后下方跟腱部位的疼痛，尤其在活动后疼痛可能会加重。
4.跟腱损伤
严重的外伤可能导致跟腱断裂等损伤，比如突然的暴力牵拉跟腱，常见于篮球运动员急停时。跟腱损伤后会出现小腿后骨头周围剧烈疼痛，伴有明显的活动受限，甚至可能出现跛行。
5.胫骨应力性骨折
常见于长期从事跑跳等运动的人群，如运动员。由于长期反复的应力作用于胫骨，骨组织发生微小损伤不断积累，最终导致应力性骨折。表现为小腿后骨头部位逐渐加重的疼痛，开始可能在活动时出现，随着病情发展休息时也可能疼痛，局部可能有轻度肿胀。
此外，跟骨骨刺是由于跟骨周围的肌腱反复牵拉，引起骨膜下新骨形成。多见于中老年人，骨刺刺激周围组织会导致小腿后骨头附近疼痛，尤其在晨起下地第一步时疼痛明显，活动后可能会有所缓解，但长时间行走后又会加重。
