胆汁分泌不足与消化酶缺乏均会因营养物质消化吸收障碍引发消化不良，主要表现为餐后腹胀、脂肪泻、体重下降等症状，严重时可导致营养不良及维生素缺乏。
餐后消化不适是最常见表现：胆汁与消化酶不足导致食物排空延迟，餐后1-2小时内腹胀、嗳气、恶心明显，尤其进食高脂、高蛋白食物后症状加重（因脂肪消化需胆汁乳化，蛋白质需胰蛋白酶分解），部分患者伴反酸、烧心，长期可发展为慢性胃食管反流。
脂肪消化障碍特征显著：胆汁中的胆盐负责乳化脂肪形成微胶粒，胰酶（如胰脂肪酶）进一步分解脂肪酸，两者缺乏时脂肪无法充分消化吸收，表现为典型脂肪泻（大便量多、色浅灰、表面漂浮油花、恶臭，每日排便3-5次），长期因能量摄入不足出现体重下降、营养不良性水肿，儿童患者可伴生长发育迟缓。
蛋白质吸收不良表现为：胃蛋白酶、胰蛋白酶活性不足导致蛋白质分解为氨基酸受阻，吸收利用率下降，血液中白蛋白、球蛋白水平降低（血清白蛋白＜35g/L提示低蛋白血症），患者出现肌肉无力、易疲劳、免疫力下降，严重时因组织水肿影响呼吸循环功能，甚至诱发心衰。
脂溶性维生素缺乏症状：维生素A、D、E、K需胆汁帮助形成的混合微胶粒吸收，缺乏时：维生素A缺乏致夜盲症、干眼症（暗适应能力下降）；维生素D不足引发骨密度降低、骨质疏松（尤其老年患者）；维生素E缺乏导致皮肤干燥、神经传导异常（如手脚麻木）；维生素K缺乏时凝血因子Ⅱ、Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ合成减少，易出现牙龈出血、皮下瘀斑等凝血功能异常。
特殊人群症状特点：老年人消化功能退化，胆汁分泌量减少（约为青年的50%），症状更隐匿，以餐后饱胀、食欲下降为主，易被误认为“衰老正常现象”；术后患者（如胆切除、胃肠吻合术后）因胆汁或消化酶分泌锐减，脂肪泻症状突出（术后1-3个月达高峰），需长期补充消化酶；慢性病患者（如糖尿病、肝病）因基础病影响消化功能，常合并餐后血糖波动（碳水吸收异常）与肝性营养不良，症状叠加加重营养失衡风险。
