高压氧治疗有中耳气压伤、氧中毒、减压病等常见副作用，中耳气压伤是因中耳腔与外界气压不平衡致鼓膜问题，儿童等易发生；氧中毒是长时间吸高浓度氧引起，儿童等更敏感；减压病是快速减压致体内气体形成气泡引发病变，儿童等易出现，且受多种因素影响。
发生机制：在高压氧治疗过程中，由于中耳腔与外界气压不平衡，当压力变化时，中耳内的气体无法及时排出，导致中耳内压力低于外界压力，引起鼓膜内陷、充血甚至穿孔等情况。例如，当患者存在上呼吸道感染、咽鼓管功能不良时，更易发生中耳气压伤。
影响因素：年龄方面，儿童咽鼓管相对短、宽、平，且儿童可能不能很好配合做吞咽、捏鼻鼓气等动作来调节中耳压力，所以儿童发生中耳气压伤的风险相对较高；生活方式上，治疗前有上呼吸道感染、鼻塞等情况会增加风险；病史方面，有咽鼓管病变病史的患者也更易出现该副作用。
氧中毒
发生机制：长时间吸入高浓度氧气可导致氧中毒。氧中毒可分为肺型氧中毒和脑型氧中毒等。肺型氧中毒主要表现为咳嗽、胸痛、呼吸困难等，是由于高浓度氧刺激肺组织产生炎症反应；脑型氧中毒可出现惊厥、昏迷等神经系统症状，是因为高浓度氧影响了神经系统的正常功能。
影响因素：年龄上，儿童神经系统等发育尚不完善，对氧中毒更敏感；生活方式中，治疗压力、治疗时间等是重要因素，高压环境下长时间吸氧更易引发氧中毒；病史方面，有肺部疾病、神经系统疾病等基础病史的患者，发生氧中毒的风险可能增加。
减压病
发生机制：当人体从高压环境快速减压时，体内溶解的气体形成气泡，若气泡在血管内或组织中形成，可引起血管阻塞、组织缺血等一系列病理改变。例如，氮气在高压下溶解于血液和组织中，减压过快时，氮气形成气泡。
影响因素：年龄上，儿童的机体代谢、对压力变化的适应能力与成人不同，相对更易发生减压病；生活方式中，治疗前身体状况不佳、减压速度过快等会增加风险；病史方面，有血液系统疾病、血管疾病等病史的患者，发生减压病的可能性增大。
