小儿急性扁桃体炎的治疗包括一般治疗、药物治疗、中医治疗和手术治疗。一般治疗有休息、饮食和口腔护理；药物治疗分抗生素应用和对症治疗；中医治疗有中药内服和外治；手术治疗适用于反复急性发作、引发并发症或扁桃体过度肥大影响吞咽呼吸且急性炎症消退后的情况，6岁以下小儿生理性肥大慎选。
口腔护理：保持口腔清洁，年龄较大能配合的患儿可使用含漱液漱口，比如生理盐水等，每日数次，以清除口腔内的分泌物和食物残渣，减少细菌滋生，促进炎症恢复。
药物治疗
抗生素应用：如果是细菌感染引起的小儿急性扁桃体炎，如A组乙型溶血性链球菌等感染，可选用抗生素治疗。常用的有青霉素类等抗生素，但需根据患儿具体情况及是否有过敏史等选择合适药物。对于青霉素过敏的患儿可选用头孢菌素类等其他合适抗生素。
对症治疗药物：若患儿有发热症状，对于体温不是特别高（如体温＜38.5℃）且一般情况良好的患儿，可先采用物理降温，如用温毛巾擦拭额头、腋窝、腹股沟等部位；若体温≥38.5℃且伴有不适，可根据年龄选择合适的退热药物，如对乙酰氨基酚等（需注意不同年龄段小儿的剂量差异等）。如果患儿有咽痛较明显的情况，可适当使用一些局部缓解咽痛的药物，如含服喉片等，但要注意药物的适用年龄等。
中医治疗
中药内服：可根据小儿急性扁桃体炎的辨证分型给予相应中药治疗，如属风热外侵证，可选用银翘散加减等；若属肺胃热盛证，可选用清咽利膈汤加减等，但需由专业中医师根据患儿具体病情进行辨证论治，且要考虑小儿的年龄、体质等因素来确定用药。
中医外治：可采用中药含漱、吹喉等外治方法，如用金银花、连翘等中药煎水含漱，或用冰硼散等吹喉，但操作时要注意轻柔，避免损伤小儿咽喉部黏膜，同时要根据小儿年龄等调整药物浓度和使用方式。
手术治疗
一般情况下小儿急性扁桃体炎不首先考虑手术治疗，但如果患儿出现反复急性发作，每年发作达5-7次以上，或已引起风湿热、肾炎等并发症，且扁桃体过度肥大影响吞咽、呼吸等情况时，可在急性炎症消退后考虑行扁桃体切除术。但手术要严格掌握适应证，并且要充分评估小儿的全身情况，包括营养状况、心肺功能等，对于年龄较小的患儿要谨慎选择手术时机，因为小儿的扁桃体在免疫功能中还有一定作用，一般6岁以下小儿的扁桃体生理性肥大，不轻易行扁桃体切除术。
