僵直性脊椎炎病因未完全明确，由遗传与环境因素相互作用所致，遗传因素中HLA-B27相关性密切且有其他基因相关，环境因素含感染、免疫、生活方式等方面影响，有家族遗传史人群需关注身体状况，生活中应避免不良因素，患病者早期诊治可控病情。
人类白细胞抗原：遗传因素在僵直性脊椎炎的发病中起着重要作用，其中人类白细胞抗原-B27（HLA-B27）与僵直性脊椎炎的相关性最为密切。研究表明，90%以上的僵直性脊椎炎患者携带HLA-B27基因，而普通人群中HLA-B27的阳性率仅为4%-8%。遗传因素通过影响免疫系统相关基因的表达等方式，增加了个体患僵直性脊椎炎的易感性。例如，家族中有僵直性脊椎炎患者的人群，其亲属患该病的风险比普通人群显著升高。
其他基因：除了HLA-B27基因外，还有一些其他基因也可能与僵直性脊椎炎的发病相关，不过它们在发病中的具体作用机制相对复杂，还需要进一步深入研究。
环境因素
感染因素：某些感染可能与僵直性脊椎炎的发病有关。例如，肠道细菌感染，尤其是某些特定的肠道病原菌，可能通过分子模拟机制诱发免疫反应。当肠道细菌的某些成分与人体自身组织的成分结构相似时，人体的免疫系统会错误地将自身组织当作外来病原体进行攻击，从而引发针对关节等部位的免疫炎症反应，最终导致僵直性脊椎炎的发生。常见的与肠道感染相关的细菌如耶尔森菌等。
免疫因素：免疫系统异常在僵直性脊椎炎的发病中占据关键地位。患者的免疫系统会出现紊乱，导致炎症因子大量释放，如肿瘤坏死因子-α（TNF-α）等炎症因子水平升高，这些炎症因子会引起关节滑膜、韧带等组织的炎症反应，进而导致关节的炎症、破坏和僵直等病理改变。例如，TNF-α能够促进炎症细胞的聚集和活化，加重关节的炎症损伤过程。
生活方式因素：长期不良的生活方式也可能对僵直性脊椎炎的发病有一定影响。例如，长期居住在潮湿、寒冷的环境中，可能会影响身体的血液循环和免疫系统功能，增加患病风险。另外，吸烟也被认为是僵直性脊椎炎的一个危险因素，吸烟会影响免疫系统的功能，还可能通过多种途径加重炎症反应，从而促进僵直性脊椎炎的发生发展。
对于有家族遗传史的人群，应密切关注自身身体状况，尤其是出现腰背部疼痛等疑似症状时要及时就医检查。在生活中，要尽量避免长期处于潮湿寒冷环境，保持良好的生活习惯，如戒烟等，以降低患病风险。对于已经患病的患者，早期诊断和规范治疗有助于控制病情进展，提高生活质量。
