男性尿道感染主要由细菌逆行感染引起，最常见病原体为大肠杆菌，其他原因包括泌尿系统结构异常、免疫力低下、医源性操作及不良生活习惯等。
病原体感染：主要为细菌感染，以革兰阴性菌为主，其中大肠杆菌占比最高（70%-90%），其次为变形杆菌、克雷伯菌、肠球菌等。少数情况下，真菌感染（如念珠菌）或病毒感染（如HSV）也可能导致尿道感染，尤其在免疫力严重低下或长期使用广谱抗生素者中。
泌尿系统结构或功能异常：前列腺增生（BPH）是老年男性常见病因，增生组织压迫尿道导致尿液排出不畅，残余尿量增加，细菌易在滞留尿液中繁殖；尿道狭窄（如外伤、慢性炎症或手术瘢痕）会阻碍尿液正常流动，增加感染风险；泌尿系统结石（如膀胱结石）可能阻塞尿道，造成尿液淤积，为细菌滋生提供环境。
免疫力低下或合并基础疾病：糖尿病患者因血糖升高，尿液中糖分含量增加，为大肠杆菌等细菌提供良好培养基；长期使用免疫抑制剂（如糖皮质激素、生物制剂）或患有慢性肾病等基础疾病，会削弱机体免疫防御功能，导致感染风险上升；老年男性随年龄增长，身体机能衰退，免疫力相对降低，尤其合并前列腺增生时，感染风险进一步增加。
医源性因素：导尿术（如术后、重症监护）或尿道内器械检查（如膀胱镜）可能破坏尿道黏膜屏障，将皮肤或肠道细菌带入尿道；长期留置导尿管（尤其是超过7天）会显著提高感染概率，每延长1天留置时间，感染率约增加5%-10%；部分手术（如经尿道前列腺电切术）后，尿道黏膜损伤或局部止血不当，也可能诱发感染。
不良生活方式及卫生习惯：饮水不足（每日饮水量＜1500ml）会导致尿液浓缩，冲刷作用减弱，细菌滞留时间延长；长期憋尿（＞8小时）使膀胱过度充盈，细菌繁殖环境稳定；不洁性行为（尤其是与多性伴者）可能传播淋球菌、衣原体等病原体，诱发淋菌性或非淋菌性尿道炎；久坐不动（如办公室工作者）、缺乏运动，会影响局部血液循环，降低免疫力，增加感染风险。
老年男性（尤其是合并前列腺增生者）需定期监测前列腺功能，避免因排尿不畅诱发感染；糖尿病患者应严格控制血糖，避免尿液中糖分成为细菌培养基；性活跃男性需注意性生活卫生，避免高危性行为；长期憋尿或久坐者建议每1-2小时排尿一次，保持每日饮水量1500-2000ml，以降低感染风险。
