抗生素有诸多坏处，包括导致细菌耐药性，使治疗感染性疾病更困难、成本增加且不同年龄人群风险不同；引起不良反应，如消化道反应、肝肾功能损害、过敏反应等，不同人群受影响情况有别；还会破坏肠道菌群平衡，引发肠道疾病，婴幼儿更易受影响。
一、导致细菌耐药性
1.原理及影响
当细菌多次接触抗生素时，为了生存会逐渐发生变异，使得自身对原本有效的抗生素产生抵抗能力。例如肺炎链球菌对青霉素类抗生素的耐药情况较为常见，随着耐药菌株的增多，治疗肺炎链球菌感染时就需要使用更高剂量或更强效的抗生素，甚至可能出现原本有效的抗生素不再能控制感染的局面，使得感染性疾病的治疗变得更加困难，治疗周期延长，医疗成本增加。从全球范围来看，细菌耐药性已经成为一个严峻的公共卫生问题，据世界卫生组织（WHO）估计，每年全球有数十万人因为耐药菌感染而死亡。
不同年龄人群面临的细菌耐药风险有所不同，儿童由于自身免疫系统发育不完善，在使用抗生素过程中更容易促使细菌产生耐药性相关变异。例如儿童常见的呼吸道感染，不合理使用抗生素会加速耐药菌在儿童群体中的传播。
二、引起不良反应
1.消化道反应
很多抗生素会引起消化道不适，如恶心、呕吐、腹泻等。以大环内酯类抗生素为例，阿奇霉素较为常见的不良反应就是胃肠道反应，约10%-16%的患者会出现腹痛、腹泻、恶心、呕吐等症状。这是因为抗生素在抑制或杀灭细菌的同时，也可能影响胃肠道正常的菌群平衡，破坏胃肠道的微生态环境，从而导致消化道功能紊乱。对于儿童来说，他们的胃肠道功能相对脆弱，使用抗生素后出现消化道反应的概率可能更高，而且儿童可能因为呕吐、腹泻导致脱水等并发症，需要特别关注。
2.肝肾功能损害
部分抗生素会对肝肾功能造成影响。例如氨基糖苷类抗生素中的庆大霉素，长期或大剂量使用可能会损害肾脏功能，导致肾功能减退，出现肌酐升高、尿量减少等情况；一些头孢菌素类药物可能会引起肝功能异常，如血清转氨酶升高等。老年人由于肝肾功能本身随着年龄增长而逐渐减退，在使用抗生素时更容易受到肝肾功能损害的影响，因为他们的机体代谢和排泄功能下降，药物在体内的半衰期延长，积累的风险增加。儿童的肝肾功能还在发育中，使用抗生素时也需要密切监测肝肾功能指标，避免因药物导致肝肾功能损伤。
3.过敏反应
抗生素是常见的过敏原之一，可引起皮疹、瘙痒、药物热、血管神经性水肿甚至过敏性休克等严重过敏反应。青霉素类抗生素是最常见的引起过敏反应的药物之一，严重的青霉素过敏休克如果不及时抢救，可能会在短时间内危及生命。不同年龄、不同个体对抗生素的过敏反应发生率有所差异，有过敏体质的人群使用抗生素时发生过敏反应的风险更高。儿童如果有明确的抗生素过敏史，在后续治疗中需要避免使用相关过敏的抗生素，并且在就医时要及时告知医生过敏史，以防止过敏反应的发生。
三、破坏肠道菌群平衡
1.肠道菌群的重要性及影响
人体肠道内存在大量有益菌群，它们对维持肠道正常的消化吸收功能、免疫功能等起着重要作用。抗生素在杀灭致病细菌的同时，也会无差别地破坏肠道中的有益菌群，导致肠道菌群失调。例如长期使用广谱抗生素，会使肠道内的双歧杆菌、乳酸杆菌等有益菌数量大幅减少，而一些条件致病菌如艰难梭菌等可能会大量繁殖，从而引发伪膜性肠炎等疾病，出现剧烈腹泻、腹痛、发热等症状。对于婴幼儿来说，他们的肠道菌群还处于建立和完善阶段，使用抗生素后更容易出现肠道菌群失调的情况，进而影响营养物质的消化吸收，导致生长发育受到一定影响。
