甲状腺功能减退的原因主要有自身免疫性疾病、医学治疗、药物因素、先天性因素等。
1.自身免疫性疾病
桥本甲状腺炎是最常见原因，机体免疫系统异常，产生抗甲状腺抗体，攻击甲状腺组织，导致甲状腺滤泡破坏，甲状腺激素合成和分泌减少，引发甲减，女性发病率高于男性，常伴随甲状腺肿大，部分患者无明显症状。
2.医学治疗
甲状腺因甲状腺癌、甲亢等疾病进行部分或全部切除后，甲状腺组织减少，激素合成不足导致甲减，放射性碘治疗通过破坏甲状腺组织治疗甲亢，如果破坏过度，也会引发甲减。
3.药物因素
长期服用锂剂、胺碘酮等药物，会抑制甲状腺激素合成或释放，导致甲减，服用抗甲状腺药物治疗甲亢时，如果剂量过大，也可能引发药物性甲减。
4.先天性因素
先天性甲状腺发育不全或甲状腺激素合成相关酶缺陷，导致新生儿出生后即出现甲减，如果未及时发现和治疗，会影响生长发育和智力发育，引发克汀病，此外，先天性甲状腺缺如也会导致甲减。
