慢性肠炎的治疗周期因病因、病情严重程度及个体差异存在较大差异，一般情况下，感染性或功能性病因导致的慢性肠炎，规范治疗后数周至数月内可缓解；自身免疫性及慢性炎症性肠病则可能需要长期管理，缓解期可持续数月至数年。
一、感染性慢性肠炎：多由细菌、寄生虫等病原体持续感染或治疗不彻底引发，治疗核心为针对性抗感染。细菌感染需遵医嘱使用敏感抗生素，寄生虫感染需规范驱虫，多数患者经4-8周治疗后症状明显改善，儿童患者需避免低龄使用刺激性抗生素，优先选择儿童专用剂型并严格监测生长发育指标，免疫低下者疗程可能延长至12周以上。
二、自身免疫性慢性肠炎：包括克罗恩病、溃疡性结肠炎等，需长期药物管理（如氨基水杨酸制剂、免疫调节剂等），临床缓解后仍需维持治疗以预防复发，多数患者缓解期需持续3-6个月，部分患者需终身监测。老年人及合并糖尿病、肝肾功能不全者需更密切监测药物副作用，避免自行停药，女性患者因激素波动可能症状反复，需加强情绪管理。
三、功能性慢性肠炎：无器质性病变，与肠道菌群失调、精神心理因素相关，治疗以非药物干预为主。规律饮食、避免生冷刺激性食物，配合益生菌调节肠道菌群，多数患者在1-3个月内症状改善，严重伴随焦虑抑郁者需结合心理疏导，孕妇患者优先通过饮食和物理方法缓解症状，严格遵医嘱调整治疗方案。
四、其他病因慢性肠炎：如药物相关性（长期服用非甾体抗炎药）、放射性肠炎等，需先去除病因（如停药或调整放疗方案），治疗以肠道黏膜保护和营养支持为主，药物治疗通常4-12周，待黏膜修复后逐渐停药。合并基础疾病（如肠易激综合征）的患者需同步管理基础病，避免相互影响，儿童患者需优先选择安全的非药物干预方式，如热敷、轻柔按摩腹部缓解不适。
特殊人群注意事项：婴幼儿及低龄儿童应避免自行用药，治疗期间需密切观察腹泻、腹痛频率变化；老年患者消化功能较弱，饮食调整需循序渐进，避免油腻食物加重肠道负担；肝肾功能不全者慎用经肝肾代谢药物，优先选择肠道局部作用药物；合并免疫性疾病者需在医生指导下缩短药物疗程，避免过度抑制免疫功能。
