扁桃体化脓可由病原体感染、机体抵抗力下降、邻近器官炎症蔓延引起。病原体感染包括细菌（如A族乙型溶血性链球菌、葡萄球菌）和病毒（如EB病毒、疱疹病毒）感染；机体抵抗力下降与年龄（儿童免疫系统未全发育、老年人机体功能衰退）、生活方式（过度劳累、营养不良、缺乏运动）有关；邻近器官炎症蔓延如鼻腔及鼻窦炎症、咽部其他器官炎症可波及扁桃体引发化脓。
A族乙型溶血性链球菌：是引发扁桃体化脓最常见的致病菌之一。这类细菌常存在于人的咽部及扁桃体隐窝内，当人体抵抗力下降时，如受凉、过度劳累等，细菌大量繁殖，侵袭扁桃体组织，导致扁桃体出现炎症反应，进而化脓。例如，在儿童群体中，由于其免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易受到A族乙型溶血性链球菌的侵袭而引发扁桃体化脓。
葡萄球菌：金黄色葡萄球菌等葡萄球菌也可引起扁桃体化脓。葡萄球菌可通过空气飞沫传播等方式进入人体扁桃体部位，在适宜的条件下生长繁殖，引起扁桃体组织的炎症，出现化脓现象。对于一些患有基础疾病、体质较弱的人群，如患有糖尿病的患者，其机体抵抗力较差，葡萄球菌等病原体更容易感染扁桃体导致化脓。
病毒感染：
EB病毒：EB病毒感染可引起传染性单核细胞增多症，其中扁桃体化脓是该疾病的常见表现之一。EB病毒主要通过密切接触传播，如飞沫、唾液等。在青少年群体中较为常见，感染后会导致扁桃体出现炎症，表现为红肿、化脓等症状。
疱疹病毒：单纯疱疹病毒等疱疹病毒感染也可能累及扁桃体，引起扁桃体化脓。疱疹病毒感染具有一定的自限性，但在感染过程中，扁桃体组织会出现炎症反应，出现化脓情况。在儿童疱疹性咽峡炎中，部分患儿可能会伴发扁桃体化脓。
机体抵抗力下降
年龄因素：
儿童：儿童的免疫系统尚处于发育阶段，抵抗力相对较弱。例如，婴幼儿的扁桃体免疫功能尚未完全建立，更容易受到各种病原体的侵袭。随着年龄增长，免疫系统逐渐完善，儿童扁桃体化脓的发生率会相对降低，但在特定的诱因下，如受凉、感染等，仍可能发生。
老年人：老年人的机体功能逐渐衰退，包括免疫系统功能下降。老年人的扁桃体组织也会出现一定程度的退行性变化，抵抗力降低，容易受到病原体感染而引发扁桃体化脓。而且老年人往往可能合并有其他基础疾病，如心血管疾病、糖尿病等，这些基础疾病会进一步削弱机体的抵抗力，增加扁桃体化脓的风险。
生活方式因素：
过度劳累：长期过度劳累会使人体的免疫力下降。例如，一些从事高强度体力劳动或长时间熬夜工作的人，身体处于疲劳状态，抵抗力降低，容易让病原体有可乘之机，从而引发扁桃体化脓。
营养不良：长期营养不良会导致机体缺乏必要的营养物质，如维生素C、蛋白质等，影响免疫系统的正常功能。例如，一些挑食、节食的人群，由于营养摄入不均衡，容易出现扁桃体化脓的情况。
缺乏运动：缺乏运动的人身体的新陈代谢减缓，免疫力也会随之降低。例如，长期久坐不动的人，机体的抗病能力下降，更容易受到病原体感染而引发扁桃体化脓。
邻近器官炎症蔓延
鼻腔及鼻窦炎症：
鼻腔和鼻窦与扁桃体位置相邻，鼻腔及鼻窦的炎症可蔓延至扁桃体。例如，鼻窦炎时，鼻窦内的炎症分泌物可能通过后鼻孔蔓延至扁桃体，引起扁桃体的炎症反应，进而导致化脓。儿童的鼻窦发育尚不完善，鼻窦炎相对较为常见，因此儿童因鼻窦炎症蔓延引发扁桃体化脓的情况也较为多见。
咽部其他器官炎症：
如咽炎等咽部其他器官的炎症，炎症可向扁桃体扩散。咽炎时，咽部的炎症刺激可波及扁桃体，使扁桃体组织受到影响，出现炎症反应，严重时可导致化脓。一些慢性咽炎患者，如果病情控制不佳，炎症长期刺激扁桃体，也可能引发扁桃体化脓。
