体格检查包含身高体重与腰围（用于计算体重指数评估营养状况及关注男性腰围）、外生殖器检查（观察阴茎、阴囊等情况）；实验室检查有精液分析（禁欲后手淫采集评估生育能力等）、血液检查（性激素六项了解内分泌、血常规看有无贫血感染、生化检查知肝肾功能血糖血脂等）；影像学检查有超声检查（阴囊超声看睾丸等结构、前列腺超声知前列腺情况）；其他检查有尿常规（判断泌尿系统与男科相关疾病）、前列腺液检查（助诊前列腺炎等），不同年龄男性体检重点不同，特殊生活方式及既往病史男性体检有相应侧重。
身高、体重与腰围：身高体重可用于计算体重指数（BMI），评估营养状况，BMI=体重（kg）/身高（m）的平方，正常范围一般在18.5~23.9kg/m2，过高或过低都可能提示健康问题。腰围的测量对于评估腹部脂肪堆积情况很重要，男性腰围超过90cm可能增加代谢相关疾病风险。
外生殖器检查：观察阴茎的大小、形态，有无畸形、硬结、包皮过长或包茎等情况；检查阴囊的大小、对称性，有无鞘膜积液、精索静脉曲张、睾丸异常（如睾丸的位置、大小、质地等）。例如正常睾丸大小约12~25ml，质地中等偏软。
实验室检查
精液分析：这是男科非常重要的检查项目。一般需要禁欲2~7天后通过手淫的方式采集精液，检查内容包括精液量、精子浓度、精子活力（前向运动精子的比例等）、精子形态等。精液量正常应在1.5ml以上，精子浓度正常范围是≥15×10/ml，前向运动精子比例（PR）≥32%，正常形态精子比例≥4%等。通过精液分析可以评估男性的生育能力等情况。
血液检查
性激素六项：包括睾酮、雌二醇、黄体生成素、卵泡刺激素、泌乳素、孕酮。睾酮对于维持男性的第二性征、性欲和生殖功能等起重要作用，正常男性血清睾酮水平一般在12~35nmol/L。通过性激素六项检查可以了解男性内分泌功能是否正常，比如睾酮水平过低可能导致性欲减退、勃起功能障碍等问题。
血常规：可以了解有无贫血、感染等情况。例如如果存在感染，可能会出现白细胞计数升高等表现。
生化检查：包括肝功能、肾功能、血糖、血脂等。肝功能检查中的转氨酶等指标可以反映肝脏的基本功能，肾功能中的肌酐等指标可以反映肾脏的排泄功能，血糖血脂水平对于评估代谢综合征等相关疾病与男科疾病的关系有重要意义，比如糖尿病可能会引起勃起功能障碍等并发症。
影像学检查
超声检查
阴囊超声：可以清晰地观察睾丸、附睾、精索静脉等结构。对于睾丸肿瘤、附睾炎、精索静脉曲张等疾病的诊断有重要价值。例如精索静脉曲张在超声下可以观察到精索静脉迂曲扩张等表现。
前列腺超声：能了解前列腺的大小、形态、有无前列腺增生、前列腺结石等情况。正常前列腺大小约4cm×3cm×2cm，通过超声可以测量前列腺的体积等指标。
其他检查
尿常规：可以了解尿液中有无红细胞、白细胞、蛋白质等情况，对于判断泌尿系统有无感染、结石、肾脏病变等与男科相关的疾病有帮助，比如前列腺炎患者可能会出现尿常规中白细胞增多等表现。
前列腺液检查：通过前列腺按摩获取前列腺液，检查前列腺液中的白细胞数量、卵磷脂小体数量等。正常前列腺液中卵磷脂小体较多，白细胞一般＜10个/高倍视野。前列腺液检查对于诊断前列腺炎等疾病有重要意义。
对于不同年龄的男性，体检重点可能有所不同。年轻男性如果有生育需求等情况，精液分析等检查可能更为关注；中老年男性则更要注重前列腺相关检查以及心血管疾病相关的生化指标检查等。有特殊生活方式的男性，比如长期久坐、吸烟饮酒等，可能需要更关注前列腺健康、心血管指标等情况。有既往病史的男性，比如有过生殖系统感染病史等，在体检时需要针对性地增加相关检查项目的复查等。
