贝赫切特综合征病因未完全明确，可能与遗传因素（如HLA-B51基因关联，不同种族及年龄段关联情况不同）、感染因素（细菌如链球菌等、病毒如单纯疱疹病毒等感染可能触发发病，不同生活环境及人群感染风险和影响不同）、免疫异常（T、B淋巴细胞功能紊乱，Th等比例及细胞因子平衡失调致慢性炎症，不同性别年龄免疫调节机制有差异，治疗需个体化调节免疫异常）有关。
基因关联：研究发现贝赫切特综合征与某些基因存在关联。例如，人类白细胞抗原（HLA）-B51基因在贝赫切特综合征患者中具有较高的阳性率。不同种族中HLA-B51基因与贝赫切特综合征的关联程度可能有所差异，在白种人、土耳其人、伊朗人等群体中，HLA-B51基因与贝赫切特综合征的相关性更为显著。从年龄角度来看，不同年龄段的人群携带相关基因后发病的风险可能不同，但目前关于基因与年龄相关性的具体机制尚不十分清晰。对于有家族遗传倾向的人群，尤其是携带相关基因的个体，在生活中需要更加关注自身健康状况，定期进行体检，以便早期发现可能出现的贝赫切特综合征相关症状。
感染因素
病原体感染：
细菌感染：某些细菌感染可能与贝赫切特综合征的发病有关。例如，链球菌、葡萄球菌等细菌感染可能触发机体的免疫反应。在生活方式方面，如果长期处于卫生条件较差的环境中，更容易接触到这些细菌，增加感染风险。对于儿童来说，由于免疫系统尚未完全发育成熟，在幼儿园等集体生活环境中，接触细菌的机会较多，若发生细菌感染后未能及时有效控制，可能会影响免疫系统的正常调节，从而增加贝赫切特综合征的发病可能性。
病毒感染：单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等病毒感染也被认为与贝赫切特综合征的发病相关。病毒感染后可能会改变机体的免疫状态，导致免疫调节失衡。不同年龄的人群感染病毒后的表现和后续影响有所不同，儿童感染病毒后恢复相对较快，但如果病毒持续感染或引发过度免疫反应，也可能为贝赫切特综合征的发病埋下隐患。在生活中，避免与病毒携带者过度密切接触，保持良好的个人卫生习惯，对于降低病毒感染风险有一定帮助。
免疫异常
免疫系统失调：贝赫切特综合征患者存在明显的免疫异常。免疫系统中的T淋巴细胞、B淋巴细胞等功能出现紊乱。T淋巴细胞亚群失衡，辅助性T细胞（Th）和细胞毒性T细胞（Tc）的比例失调，Th1/Th2细胞因子平衡失调，Th1型细胞因子如干扰素-γ等分泌增多，导致机体处于慢性炎症状态。这种免疫失调在不同性别、不同年龄的人群中都可能发生，但具体的免疫调节机制在不同个体间存在差异。对于女性患者，由于其内分泌系统的特点，在月经周期等生理变化过程中，可能会影响免疫系统的状态，进而对贝赫切特综合征的病情产生一定影响。在治疗方面，针对免疫异常的调节是重要的治疗方向，但需要根据患者的具体免疫状态进行个体化的调整。
