钩端螺旋体病症状多样，分为早期、中期和后期表现，早期有急骤发热、畏寒寒战、头痛、全身肌肉酸痛等；中期包括肺出血型（咯血等）、黄疸出血型（黄疸、出血倾向、肾功能损害）、脑膜脑炎型（脑膜刺激征、头痛呕吐、意识障碍）、肾功能衰竭型（少尿无尿等）；后期部分患者热退后数日至3个月左右可出现眼后发症（视力模糊等）、神经系统后发症（神经系统功能障碍）等后发症，不同人群表现有差异。
一、早期症状
1.发热
多为急骤起病，体温可在数小时内升至39℃左右，呈稽留热或弛张热型。发热可持续数天至2周不等。不同年龄人群发热表现可能略有差异，儿童可能体温波动相对更明显，生活方式健康者和病史无特殊者发热特点与一般人群无本质区别，但有基础疾病者发热可能更易反复或伴有其他基础病相关表现。
常伴有畏寒或寒战。
2.头痛
头痛较为常见，可为全头痛或前额、枕部等部位疼痛，程度轻重不一。一般与发热同时或随后出现，可能与钩端螺旋体感染引起的全身炎症反应有关。
3.全身肌肉酸痛
以腓肠肌（小腿肚子）、腰背肌肉酸痛最为突出，患者可感觉腓肠肌有明显压痛，行走时疼痛加剧，腰背肌肉酸痛可影响患者的活动和体位改变。这是因为钩端螺旋体在体内繁殖，引起肌肉组织的炎症反应等病理改变。
二、中期症状（器官损伤期）
1.肺出血型
可出现不同程度的咯血，轻者仅痰中带血，重者可大量咯血，甚至出现大咯血导致窒息等严重情况。肺部听诊可能可闻及湿性啰音等异常体征，胸部影像学检查可见肺部阴影等改变。不同年龄患者肺出血表现有所不同，儿童可能更易因咯血导致气道堵塞等危急情况，需密切关注呼吸情况，生活方式健康者和有基础肺疾病者肺出血可能更易加重。
2.黄疸出血型
出现黄疸，血清胆红素升高，表现为皮肤、巩膜黄染。同时可能伴有出血倾向，如皮肤瘀点、瘀斑、鼻出血、牙龈出血等，还可能有肾功能损害相关表现，如尿量减少、血肌酐升高等。这是由于钩端螺旋体累及肝脏和肾脏，影响其正常的代谢、合成及排泄功能等。
3.脑膜脑炎型
有脑膜刺激征，如颈项强直、克氏征、布氏征阳性等，还可出现头痛加剧、呕吐（呈喷射性呕吐可能较常见）、不同程度的意识障碍，如嗜睡、烦躁不安甚至昏迷等。儿童脑膜脑炎型可能因囟门未闭等情况，颅内压增高表现可能与成人有所不同，需注意观察囟门情况等，生活方式健康者和有神经系统基础病史者发生脑膜脑炎型时病情可能更复杂。
4.肾功能衰竭型
主要表现为少尿、无尿等急性肾功能衰竭的相关症状，由于肾功能受损，体内代谢废物排泄障碍，可出现血尿素氮、肌酐升高等，同时可能伴有电解质紊乱，如高钾血症等，严重时可危及生命。
三、后期症状（恢复期或后发症期）
部分患者在热退后数日至3个月左右可出现后发症，如眼后发症，表现为虹膜睫状体炎、脉络膜炎等，出现视力模糊、眼部疼痛等；还有神经系统后发症，如脑膜炎后遗症、脊髓神经根炎等相关表现，出现相应的神经系统功能障碍症状。不同患者后发症的发生情况和表现有所差异，年龄较小患者眼后发症或神经系统后发症可能对其生长发育等产生更深远影响，需密切随访观察。
