在感染急性期及重症阶段，绝对不能饮用咖啡；在康复期，也需极为谨慎，一般不推荐。
咖啡因具有兴奋中枢神经、加速心率的作用，可能加重因脑炎导致的躁动、焦虑或心律不齐，干扰休息与治疗。其利尿作用可能加剧脱水，不利于维持稳定的血容量和血压。尼帕病毒感染常伴随恶心、呕吐，咖啡的酸度会刺激胃黏膜，可能诱发或加重胃肠道不适，影响营养吸收和药物疗效。
急性期应以口服补液盐、温水作为唯一液体来源。进入康复期后，若确需尝试，也必须在医护人员评估后，从极低咖啡因含量的饮品、极少量开始测试耐受性，并密切观察身体反应。
本内容不能作为治疗依据，如有不适请到医院进行科学治疗
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