尼帕病毒在分类学上属于副黏病毒科亨尼帕病毒属，是一种单链负义RNA病毒，与亨德拉病毒密切相关。
其基因组全长约18.2kb，是副黏病毒科中最大的基因组之一，仅有一个血清型，但根据基因组序列差异可分为马来西亚株（NiV-M）和孟加拉株（NiV-B）两个亚型。病毒颗粒呈多形性，直径150-300nm，外层为脂蛋白包膜，表面分布着糖蛋白刺突，这些结构在病毒入侵宿主细胞时发挥关键作用。尼帕病毒对热和常用消毒剂敏感，56℃加热30分钟即可灭活。
作为生物安全四级病原体，尼帕病毒具有高致病性和人际传播能力，其自然宿主为果蝠，可通过污染食物或中间宿主传播给人类。
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