尼帕病毒的宿主可分为自然宿主、中间宿主、人类宿主等。

1.自然宿主
果蝠是尼帕病毒的主要自然宿主,尤其是大型飞行狐蝠。果蝠携带病毒但通常不发病,却能通过唾液、尿液或粪便污染水果、水源等,成为病毒传播链的关键源头。
2.中间宿主
猪是尼帕病毒的重要中间宿主。病毒先由果蝠传播给猪,猪感染后可在体内大量增殖,并通过呼吸道、尿液和粪便排出病毒,人类与感染猪接触时易被传播。此外,马、羊、猫和犬等动物也可作为中间宿主感染病毒。
3.人类宿主
人类感染尼帕病毒后,会成为病毒传播链中的一环。在密切接触感染者的情况下,病毒可通过飞沫、直接接触患者的分泌物或排泄物等方式,实现人际传播。
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