尼帕病毒感染病程分4个阶段，分别是潜伏期、前驱期、急性期、恢复期与后遗症期等。
1.潜伏期
通常为四至十四天，最长记录可达四十五天。此期间患者无任何症状，但病毒已在体内复制，且潜伏期末期已具潜在传染性。
2.前驱期
通常以突发高热、剧烈头痛、肌肉酸痛和呕吐等非特异性流感样症状起病。此阶段常持续三至十天，容易被误诊为普通感冒或其他常见感染。
3.急性期
此为疾病转折点，根据病毒主要侵犯的器官系统，分化为两种主要临床类型。其一为脑炎型，患者出现嗜睡、意识混乱、抽搐甚至昏迷。其二为呼吸型，表现为急性咳嗽、呼吸困难，迅速进展为急性呼吸窘迫综合征。两种类型可单独或合并出现，此阶段病情最为危重，死亡率高。
4.恢复期与后遗症期
幸存者进入恢复期，但康复过程漫长。相当一部分患者会遗留永久性神经后遗症，如人格改变、认知障碍、肢体瘫痪等。部分康复者体内病毒仍可能在某些体液中持续存在一段时间。
本内容不能作为治疗依据，如有不适请到医院进行科学治疗
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