尿毒症主要通过肾功能核心指标、血液生化、尿液检查、影像学评估及原发病结合综合确诊，其中肾小球滤过率（eGFR）<15ml/min/1.73m2是终末期诊断的关键依据。
肾功能核心指标检查需结合血肌酐、尿素氮及估算肾小球滤过率（eGFR），通过CKD-EPI公式计算eGFR，该指标能更准确反映肾功能，eGFR<15ml/min/1.73m2是诊断尿毒症的核心标准，同时需排除急性肾损伤（如药物中毒、尿路梗阻）等可逆性病因干扰。
血液生化检测可评估全身代谢紊乱：电解质中高钾血症（血钾>5.5mmol/L）、代谢性酸中毒（碳酸氢根<22mmol/L）为典型表现；血常规显示血红蛋白降低（常<100g/L）、红细胞压积下降，提示肾性贫血；钙磷代谢异常表现为血磷>1.45mmol/L、血钙<2.0mmol/L及甲状旁腺激素（iPTH）升高，反映肾脏排磷保钙功能衰竭。
尿液检查需关注尿量变化（少尿或无尿）、尿蛋白定量（多>1g/24h，糖尿病肾病等原发病可伴大量蛋白尿）、尿比重降低（<1.015）及浓缩功能下降，尿沉渣镜检可见红细胞、白细胞或管型，需结合原发病（如高血压肾损害以肾小管改变为主，IgA肾病伴红细胞管型）。
影像学评估以肾脏超声为首选，典型表现为双肾缩小（长径<9cm）、皮质变薄（<0.5cm）、皮质回声增强及结构紊乱，双侧对称性缩小提示慢性病程；若双肾大小不对称，需警惕单侧梗阻或先天性发育异常（如马蹄肾），复杂病例可进一步行CT/MRI评估肾实质及血流。
特殊人群需结合原发病：糖尿病肾病需检测糖化血红蛋白（>7%）、眼底微血管瘤；高血压肾损害需评估血压控制史（长期>140/90mmHg）；老年人因肌肉量减少血肌酐偏低，需依赖eGFR公式（如CKD-EPI）及尿微量白蛋白等指标综合判断，避免仅以肌酐值误诊。
