肠道定植菌并非仅指真菌，而是包含细菌、真菌、病毒等多种微生物的复杂群落，真菌仅是其中一部分。
肠道定植菌是指长期定植于肠道黏膜表面，与宿主形成共生关系的微生物群体。其中，细菌是肠道定植菌的核心组成部分，如双歧杆菌、乳酸杆菌等专性厌氧菌，它们通过竞争营养、分泌抗菌物质等方式抑制有害菌生长，维持肠道菌群平衡，并参与食物消化、免疫调节等生理过程。真菌虽也属于肠道定植菌范畴，但种类相对局限，以白假丝酵母菌等条件致病菌为主，在健康状态下数量稳定，与细菌共同维持微生态平衡。
当肠道菌群失衡（如长期使用抗生素、免疫功能下降时），真菌可能过度增殖，引发感染。因此，肠道定植菌是包含真菌在内的多元微生物群落，真菌仅是其中一类，需结合菌群整体平衡判断其健康影响。
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