衣原体感染可致泌尿生殖系统出现男性尿道刺痒等、女性宫颈炎症等症状，眼部有沙眼急性期眼红等及新生儿包涵体结膜炎，呼吸道肺炎有咳嗽等；儿童泌尿生殖系统感染少见，肺炎常见且症状不典型、沙眼可发生，孕期女性感染可致宫内感染等不良妊娠结局；部分感染者无症状但具传染性，有高危暴露史即便无症状也应及时筛查以防感染扩散及并发症
一、泌尿生殖系统感染症状
男性感染衣原体后，常见尿道刺痒、尿频、尿急，尿道口可见少量黏液性分泌物，晨起时可能有“糊口”现象；病情较重时可出现尿痛、排尿困难等。女性感染后多表现为宫颈炎症，宫颈部位充血、水肿，有黏液脓性分泌物，部分患者会出现阴道分泌物增多、性交后出血，还可能伴有下腹部不适等。
二、眼部感染症状
（一）沙眼衣原体所致沙眼
急性期表现为眼红、眼痛、异物感明显，伴有大量脓性分泌物，结膜充血水肿；病情迁延可发展为慢性沙眼，出现眼睑内翻、倒睫等并发症，影响视力甚至导致失明。
（二）新生儿产道感染
新生儿通过产道感染衣原体可引发包涵体结膜炎，出生后数天至数周内出现眼睑红肿、结膜充血水肿，有脓性分泌物，若不及时处理可能影响眼部正常发育。
三、呼吸道感染症状
肺炎衣原体感染可引起肺炎，主要症状为咳嗽，多为干咳，可持续数周，部分患者伴有发热，体温可呈中低度发热，病情严重时可出现呼吸急促、喘息等，尤其在儿童中，肺炎症状可能相对更明显，需警惕影响呼吸功能。
四、不同人群症状差异
（一）儿童群体
儿童感染衣原体时，泌尿生殖系统感染相对少见，呼吸道感染中肺炎较为常见，且儿童肺炎症状可能不如成人典型，除咳嗽外，可能更易出现精神萎靡、食欲减退等表现；眼部感染中沙眼在儿童中也可能发生，需注意眼部卫生及早期干预。
（二）孕期女性
孕期女性感染衣原体可能引发宫内感染，影响胎儿发育，导致早产、胎膜早破等不良妊娠结局，同时自身可能出现泌尿生殖系统感染相关症状，需密切监测。
五、非典型症状及注意事项
部分衣原体感染者可能无明显症状，即为无症状携带者，仍具有传染性，易造成传播。因此，若有高危暴露史（如不安全性行为、接触感染源等），即使无明显不适也应及时进行筛查，以便早期发现并干预，避免感染进一步扩散及引发并发症。
