肛瘘有肛周反复肿痛、肛周流脓、肛周瘙痒及全身症状等表现，肛周反复肿痛因瘘管内口感染致炎症反应引发，不同人群表现有差异；肛周流脓是瘘管分泌物经外口流出，不同人群表现不同；肛周瘙痒由脓液刺激皮肤引起，不同人群受影响有别；全身症状多在肛瘘急性感染时因细菌毒素入血导致，不同人群表现也存在差异。
发生机制：肛瘘内口持续有感染源，细菌等病原体不断经内口进入瘘管，引发炎症反应，导致肛周出现肿痛症状。一般在脓液积聚于瘘管内时，肿痛感较为明显，当脓液排出一部分后，肿痛可能会暂时缓解，但后续会反复出现。
不同人群表现差异：儿童患者可能因表达不清，更多表现为烦躁不安、不愿行走等；成年患者能较明确表述肛周的肿痛感受，且肿痛程度可能因个体对疼痛的耐受差异而有所不同，比如长期从事重体力劳动的成年患者，可能对轻度肿痛耐受较好，而平时较为娇弱的成年患者对同样程度的肿痛可能感觉更强烈。
肛周流脓
发生机制：瘘管形成后，感染病灶不断有脓性分泌物产生，这些分泌物会通过外口流出。通常脓液的量会随病情变化，当瘘管通畅时，脓液流出相对较多；当瘘管部分堵塞时，脓液流出量会减少，但会伴有肿痛加重等情况。
不同人群表现差异：老年患者由于身体机能下降，局部血液循环相对较差，流脓情况可能相对不那么典型，有时脓液较稀薄；儿童患者肛周皮肤相对娇嫩，流脓可能会刺激肛周皮肤，导致肛周皮肤发红、瘙痒等表现相对更明显。
肛周瘙痒
发生机制：脓液等分泌物不断刺激肛周皮肤，引起瘙痒感。患者会不自觉地搔抓肛周皮肤，进一步加重皮肤损伤，可能导致皮肤破溃、感染加重等不良后果。
不同人群表现差异：女性患者由于会阴部生理结构特点，肛周瘙痒可能会对日常生活和睡眠产生较大影响，比如在社交场合或夜间休息时因瘙痒而困扰；老年女性患者可能同时合并皮肤干燥等问题，肛周瘙痒可能更顽固。儿童患者肛周瘙痒可能会影响其注意力，导致学习等活动受到一定干扰。
全身症状
发生机制：当肛瘘发生急性感染时，细菌毒素等进入血液循环，可引起全身症状。如炎症较重时，会出现发热，这是身体的免疫反应在对抗感染的表现。
不同人群表现差异：儿童免疫系统尚不完善，发生急性感染时发热可能较为明显，体温升高较快，且可能出现高热惊厥等情况；老年患者身体抵抗力较弱，发生全身症状时，发热可能相对不典型，有时仅表现为低热，且恢复相对较慢，同时可能合并有基础疾病的加重，如糖尿病患者可能出现血糖波动等。
