先天性心脏病病因尚未完全明确，目前认为主要是遗传因素（包括基因突变、染色体异常及家族遗传性倾向）与环境因素（如孕期病毒感染、药物暴露、不良生活方式等）共同作用的结果，此外多因素交互作用及特殊人群的生理状态变化也可能影响发病风险。
一、遗传因素
先天性心脏病存在明确遗传基础。一是单基因突变，如NKX2-5、GATA4等基因突变可导致心脏发育相关通路异常；二是染色体病，21三体综合征（唐氏综合征）、18三体综合征（爱德华氏综合征）等常合并复杂先心病；三是家族遗传性倾向，若家族中存在先心病患者，其他成员发病风险较普通人群升高2-3倍。
二、环境因素
孕期环境暴露是重要危险因素。妊娠早期（前12周）感染风疹病毒、巨细胞病毒等，可干扰胚胎心脏发育；接触异维A酸、某些化疗药物等致畸药物，或铅、汞等重金属，可能增加风险；母体酗酒、吸烟、过量咖啡因摄入，以及妊娠期高血压、糖尿病、甲状腺功能异常等并发症，会通过影响胎盘血流或内分泌环境诱发先心病。
三、多因素交互作用
遗传易感性与环境因素叠加显著提升风险。携带特定基因突变（如染色体微缺失）的孕妇，在孕期接触酒精或吸烟时，胎儿先心病发生率较普通人群增加5-10倍。此类多因素交互作用常见于室间隔缺损、动脉导管未闭等简单先心病及复杂型先心病，需通过综合风险评估早期干预。
四、特殊人群相关因素
高龄孕妇（≥35岁）因卵子质量下降，染色体非整倍体风险升高，先心病检出率较年轻孕妇高20%-30%；早产或宫内发育迟缓的胎儿，常伴随血管发育异常风险；母体感染弓形虫、流感病毒等其他病原体，也可能通过胎盘屏障影响胚胎发育。
备孕及孕期女性需提前进行遗传咨询，有家族史者建议孕前筛查相关基因突变；妊娠早期避免接触已知致畸物，规律产检监测胎儿心脏发育；新生儿若存在口唇发绀、气促、喂养困难等症状，需及时进行超声心动图检查，早期诊断可显著改善预后。
