呋喃妥因有多种常见副作用，包括较为常见的胃肠道反应，约10%-20%患者会出现恶心、呕吐、食欲减退等，有胃肠道基础疾病者更明显；少数患者有神经系统反应，长期或大剂量使用可能致周围神经炎；较为罕见的血液系统反应，可出现白细胞减少等，G-6-PD缺乏症患者溶血性贫血风险增加；发生率低但可能严重的过敏反应；极少数的肺部反应，可出现肺炎样表现，有肺部基础疾病者需警惕。
神经系统反应：少数患者可能出现头痛、头昏、嗜睡等症状，个别情况还可能出现周围神经炎。研究表明，长期或大剂量使用呋喃妥因时，发生周围神经炎的风险会增加。周围神经炎主要表现为手足麻木、刺痛、感觉异常等，这是由于呋喃妥因可能影响了神经系统的正常代谢和神经纤维的功能。对于患有糖尿病等周围神经病变基础疾病的患者，使用呋喃妥因时需更加谨慎，因为其本身的基础疾病可能会加重神经系统的不良反应。
血液系统反应：较为罕见，但可能出现白细胞减少、血小板减少等情况，严重时还可能导致溶血性贫血。例如，有研究报道在使用呋喃妥因的患者中，约0.1%-0.5%会出现溶血性贫血相关的血液指标异常。对于患有葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G-6-PD）缺乏症的患者，使用呋喃妥因后发生溶血性贫血的风险显著增加，因为G-6-PD缺乏会影响红细胞的代谢，使红细胞更容易受到药物等因素的损伤而发生溶血。
过敏反应：可表现为皮疹、药物热、哮喘等。一般过敏反应的发生率较低，但一旦发生可能较为严重。部分患者可能对呋喃妥因中的某些成分过敏，接触药物后免疫系统被激活，引发过敏反应。对于有药物过敏史的患者，在使用呋喃妥因前需要特别评估过敏风险，避免使用该药物或在使用过程中密切观察过敏症状的出现。
肺部反应：极少数情况下会出现肺部浸润、咳嗽、呼吸困难等肺炎样表现。有文献报道，约每万例使用呋喃妥因的患者中可能有1-2例出现肺部相关不良反应。其具体机制尚不完全明确，可能与药物引起的免疫反应或对肺部组织的直接刺激有关。对于有肺部基础疾病，如慢性阻塞性肺疾病、肺炎病史的患者，使用呋喃妥因时需警惕肺部不良反应的发生，一旦出现咳嗽、呼吸困难等症状应及时就医评估。
