抗生素使用会带来多种不良反应，包括胃肠道反应，如广谱抗生素破坏肠道菌群平衡致腹泻，儿童和老年人更易出现；过敏反应，轻者皮疹瘙痒，重者过敏性休克，有过敏史及家族过敏史者需谨慎；肝肾功能损害，长期或大剂量使用影响肝肾功能，肝肾功能不全及老年人需注意；二重感染，长期或不恰当使用致菌群失衡引发新感染，儿童和老年人风险较高；血液系统影响，个别抗生素可致骨髓抑制等，使用时需监测血液指标。
过敏反应
部分人可能对抗生素产生过敏反应，轻者表现为皮疹、瘙痒等，重者可出现过敏性休克，这是非常危险的情况。常见的易引起过敏反应的抗生素有青霉素类等。过敏反应的发生与个体的过敏体质有关，在使用抗生素前，通常需要进行皮试等过敏筛查，但即使皮试阴性，也不能完全排除过敏反应的可能性。对于有过敏史的人群，使用抗生素时需格外谨慎，应提前告知医生过敏史情况，以便医生选择合适的替代药物。儿童如果有家族过敏史，在使用抗生素时也需要更加密切观察是否出现过敏相关症状。
肝肾功能损害
一些抗生素需要通过肝脏代谢、肾脏排泄，长期或大剂量使用可能对肝肾功能造成损害。例如，氨基糖苷类抗生素可能影响肾脏功能，导致肾功能不全等问题；某些头孢菌素类药物可能对肝脏有一定影响。在使用抗生素过程中，需要监测肝肾功能指标，尤其是对于本身存在肝肾功能不全的患者，更要谨慎使用抗生素，因为他们的身体对药物代谢和排泄能力下降，更容易发生肝肾功能损害。老年人由于肝肾功能逐渐减退，使用抗生素时也需要根据肝肾功能情况调整用药方案。
二重感染
长期或不恰当使用抗生素会破坏体内正常菌群的平衡，导致耐药菌或其他条件致病菌大量繁殖，引起新的感染，即二重感染。例如，在使用广谱抗生素后，可能会出现白色念珠菌等真菌感染。儿童由于免疫系统发育不完善，使用抗生素时发生二重感染的风险相对较高；老年人身体抵抗力较弱，也容易在使用抗生素后出现二重感染情况。
血液系统影响
个别抗生素可能影响血液系统，如氯霉素可能导致骨髓抑制，引起白细胞减少、血小板减少等。不过，这类情况相对较少见，但一旦发生可能会比较严重。在使用可能影响血液系统的抗生素时，需要定期进行血常规等检查，密切监测血液指标变化。对于有血液系统疾病史的患者，使用相关抗生素时要格外谨慎评估风险。儿童使用可能影响血液系统的抗生素时，也要加强血常规监测。
