联苯双酯滴丸有常见和较少见但需关注的副作用。常见副作用包括消化系统的口干、恶心，老年患者胃肠道功能弱更易出现，儿童较少见；神经系统的少数患者头晕，服药期间过度劳累、睡眠不足可能加重。较少见但需关注的有过敏反应，过敏体质者风险高，有过敏史者需谨慎；极个别情况可能影响肝脏功能，有严重肝脏基础疾病者使用需密切监测。特殊人群中孕妇及哺乳期妇女慎用，儿童用药需特别谨慎，除非医生权衡后认为获益大于风险才可考虑使用。
消化系统方面：可能出现口干、恶心等症状。有研究显示，部分患者服用联苯双酯滴丸后会感觉口腔内津液分泌减少，出现口干现象；同时，胃肠道受到药物刺激，可能引发恶心不适，不过一般程度较轻微。从年龄因素来看，老年患者由于胃肠道功能相对较弱，可能更容易出现恶心等消化系统副作用；而儿童由于消化系统发育尚未完全成熟，对药物的耐受性和反应与成人不同，也有出现消化系统不适的可能，但相对较少见。
神经系统方面：少数患者可能有头晕的表现。这是因为药物可能对神经系统产生一定影响，干扰神经传导等过程。性别方面，目前尚无明确证据表明男性和女性在头晕等神经系统副作用的发生上有显著差异，但不同个体对药物的反应存在差异。生活方式方面，若患者在服药期间过度劳累、睡眠不足等，可能会加重头晕等神经系统不适症状。
较少见但需关注的副作用
过敏反应：较为罕见，但也有个别患者会出现皮疹、瘙痒等过敏症状。如果患者属于过敏体质，使用联苯双酯滴丸时发生过敏反应的风险相对较高。过敏体质的人群在接触药物后，免疫系统被激活，产生异常免疫反应，导致皮肤出现皮疹、瘙痒等表现。对于有过敏史的患者，在使用联苯双酯滴丸前应格外谨慎，医生需仔细评估风险收益比。
肝脏相关影响：虽然联苯双酯滴丸主要用于治疗肝脏疾病，但也有极个别情况可能对肝脏功能产生一定影响，不过这种情况非常少见。从病史角度来看，如果患者本身已有较严重的肝脏基础疾病，使用联苯双酯滴丸时需要密切监测肝功能，因为原有肝脏疾病可能会增加药物对肝脏产生不良影响的风险。
对于特殊人群，孕妇及哺乳期妇女应慎用联苯双酯滴丸，因为目前关于联苯双酯滴丸对胎儿和婴儿的安全性研究相对有限，为避免可能对胎儿或婴儿造成潜在不良影响，需在医生的严格评估下谨慎使用；儿童用药需特别谨慎，由于儿童处于生长发育阶段，药物代谢等生理过程与成人不同，应尽量避免使用，除非在医生充分权衡利弊后认为获益大于风险时才可考虑使用。
