甘露聚糖肽口服溶液的不良反应包括一般轻微不良反应如消化系统的恶心呕吐（因药物对胃肠道黏膜刺激，有胃肠道基础疾病者更易出现）和神经系统的少数患者头晕（个体差异且儿童因神经系统未成熟风险相对高）、过敏反应如皮肤表现的皮疹（过敏体质者易发生，儿童需谨慎观察）及极少数的严重过敏反应（概率低但需密切监测生命体征）、其他不良反应如个别报道的血液系统影响（本身有血液系统基础疾病者及儿童需谨慎关注）。
一般轻微不良反应：
消化系统：部分患者可能出现恶心、呕吐等症状，这是因为药物可能对胃肠道黏膜产生一定刺激，影响胃肠道正常的消化功能。一般人群在用药后可能会有此类反应，但具体发生情况因个体差异有所不同。对于有胃肠道基础疾病的患者，如胃炎、胃溃疡患者，可能更容易出现消化系统的不良反应，因为其胃肠道黏膜本身相对脆弱，药物刺激更易引发不适。
神经系统：少数患者可能出现头晕的情况，这可能与药物对神经系统的轻微影响有关，具体机制尚不完全明确，但个体对药物的神经系统反应存在差异。儿童由于神经系统发育尚未完全成熟，相比成人更易受到药物对神经系统的影响，出现头晕等不良反应的风险可能相对较高，需要密切关注儿童用药后的神经系统反应。
过敏反应：
皮肤表现：可能出现皮疹，表现为皮肤出现红色斑疹、丘疹等。这是机体对药物产生过敏反应的常见皮肤表现，是由于药物作为外来物质刺激机体免疫系统，引发免疫反应导致皮肤出现异常。过敏体质的人群相对更易发生过敏反应，在使用甘露聚糖肽口服溶液前，应询问患者的过敏史，尤其是对类似免疫调节剂的过敏情况。儿童的免疫系统相对特殊，过敏体质儿童使用该药物时更需谨慎观察，一旦出现皮疹等过敏表现需及时处理。
严重过敏：极少数患者可能出现过敏性休克等严重过敏反应，这是非常危险的情况，可表现为呼吸困难、血压下降、意识障碍等。严重过敏反应发生的概率极低，但一旦发生需立即进行抢救。无论成人还是儿童，都存在发生严重过敏反应的可能，因此在用药过程中，尤其是首次用药及用药初期，需密切监测患者的生命体征，以便及时发现严重过敏反应并进行救治。
其他不良反应：
血液系统：有个别报道可能对血液系统产生一定影响，但相对较为罕见。一般认为可能涉及对血细胞生成或代谢的轻微干扰，但具体机制有待进一步研究。对于本身有血液系统基础疾病的患者，使用该药物时需更加谨慎评估风险收益比，儿童血液系统处于不断发育变化中，使用该药物时更要关注是否对血液系统产生潜在影响，必要时需进行血常规等相关检查监测。
