男性沙眼衣原体感染可引起尿道炎、附睾炎、眼部炎症等，不同部位的症状不同。
1.尿道炎
为最常见表现，感染后1-3周可出现尿道刺痒、烧灼感，伴尿频、尿急及排尿疼痛。尿道口可见少量稀薄透明或白色浆液性分泌物，晨起时可能出现尿道口“糊口”现象。
2.附睾炎
多由尿道炎蔓延至附睾所致，表现为单侧或双侧附睾肿大、疼痛，触痛明显，阴囊皮肤可发红、肿胀。常伴发热及腹股沟区放射痛，若未及时治疗可能导致附睾管阻塞，影响精子排出，甚至引发不育。
3.眼部炎症
若感染眼部，可出现眼红、眼痒、结膜充血、畏光、眼睑粘连等眼部炎症表现。
