纵隔畸胎瘤通常建议手术治疗，不做手术会有多种不良后果，包括肿瘤增长引发压迫症状、有破裂风险及相关危害、存在恶变可能及相关影响，儿童患者不及时手术会更严重影响生长发育，老年患者不做手术因身体耐受力差风险更严重，不做手术面临诸多危及生命及生存质量的不良后果。
肿瘤增长引发压迫症状：纵隔内空间有限，畸胎瘤会逐渐增大，可能压迫周围重要组织器官。例如，压迫气管可导致呼吸困难，表现为呼吸急促、喘息等；压迫食管会引起吞咽困难，影响进食，进而导致营养不良等问题。研究表明，随着纵隔畸胎瘤体积的增大，对周围组织的压迫风险会显著增加，且压迫程度往往会随时间推移而加重。
肿瘤破裂风险及相关危害：畸胎瘤有破裂的可能，一旦破裂，瘤内容物可进入纵隔或胸腔，引起严重的炎症反应。若进入胸腔，会刺激胸膜，导致剧烈胸痛，还可能引发胸腔感染，出现发热、寒战等症状，严重时可影响心肺功能，导致心肺功能衰竭等严重后果。有临床病例报道显示，纵隔畸胎瘤破裂后引发胸腔严重感染的患者，治疗难度大幅增加，康复周期也明显延长。
恶变可能及相关影响：纵隔畸胎瘤存在恶变的可能性，一旦发生恶变，病情会迅速进展，恶化程度较高。恶变后肿瘤细胞会侵犯周围组织并发生转移，转移至其他部位的器官后，会影响相应器官的功能。例如转移至肝脏，会影响肝脏的正常代谢和解毒功能；转移至骨骼，可导致骨骼疼痛、病理性骨折等，极大地影响患者的生存质量和预后，严重威胁患者生命。
对于儿童患者，由于其身体处于生长发育阶段，纵隔畸胎瘤不及时手术可能会对其胸廓发育、心肺功能发育等产生更为严重的长期影响，阻碍正常生长发育进程，应更加积极地考虑手术干预；而对于老年患者，身体机能相对衰退，不做手术面临的上述风险可能会因为身体耐受力差而产生更严重的后果，如更难承受肿瘤压迫或破裂等情况带来的机体紊乱。总之，纵隔畸胎瘤一般建议积极手术治疗，不做手术会面临诸多严重且可能危及生命及生存质量的不良后果。
