尖锐湿疣主要由低危型人乳头瘤病毒（如HPV6型、11型等）感染引起，性行为因素中性伴侣多、初次性行为年龄小易致发病，免疫功能正常者局部免疫受影响、免疫低下者易发病，局部潮湿炎症等环境及妊娠因素也会影响发病。
性行为因素与尖锐湿疣发病密切相关
性伴侣数量：有多个性伴侣的人群感染HPV的风险显著增加。因为性伴侣越多，接触不同HPV亚型的机会就越多，更容易受到病毒感染而引发尖锐湿疣。例如，研究发现，在性生活活跃的人群中，性伴侣数大于10个的个体，尖锐湿疣的发病率明显高于性伴侣数少的人群。
初次性行为年龄：初次性行为年龄较小的人群，由于生殖系统发育尚未完全成熟，局部防御机制相对较弱，更容易感染HPV。而且青春期女性的宫颈柱状上皮外移，对HPV的抵抗力较低，所以初次性行为年龄小于16岁的女性感染HPV并发展为尖锐湿疣的几率相对较高。
免疫功能状况影响发病
免疫功能正常人群：一般情况下，人体的免疫系统能够对HPV感染进行一定程度的监视和清除。但如果局部免疫功能受到影响，如患有局部皮肤病、长期使用免疫抑制剂等情况时，就可能导致机体对HPV的清除能力下降，增加尖锐湿疣的发病风险。例如，艾滋病患者由于免疫系统严重受损，感染HPV后极易发生尖锐湿疣，且病情往往较为严重，难以治愈。
免疫功能低下人群：除了艾滋病患者外，患有其他免疫系统疾病，如系统性红斑狼疮等，或者接受器官移植后长期使用免疫抑制药物的人群，其机体对HPV的抵抗力降低，更容易感染HPV并患上尖锐湿疣。这些人群一旦感染，病变可能进展迅速，且复发率较高。
其他因素对发病的影响
局部环境因素：局部潮湿、有炎症、分泌物增多等情况会促进HPV的感染和繁殖。例如，患有阴道炎、包皮龟头炎等疾病时，局部环境适宜HPV生存，从而增加了尖锐湿疣的发病可能性。
妊娠因素：孕妇由于体内激素水平的变化，免疫系统相对受到一定影响，同时生殖器官局部的血液循环丰富，有利于HPV的繁殖，所以孕妇感染HPV患尖锐湿疣的风险增加，而且病情可能发展较快，对母婴健康都可能产生不良影响。例如，孕妇患尖锐湿疣时，可能在分娩过程中将病毒传染给新生儿，导致新生儿发生喉乳头瘤等疾病。
