性功能障碍包括勃起功能障碍（病因有心理、器质性等）、早泄（由心理、器质性等引起）、阴茎异常勃起（分缺血性和非缺血性，病因分别为血液黏稠度增高等、阴茎海绵体平滑肌功能异常等）、男性不育症（病因有精液异常、附属性腺异常、免疫因素、性功能障碍等）、男性生殖系统感染性疾病（附睾炎分急慢性，急性由细菌感染继发于尿道炎等，慢性可由急性迁延等；前列腺炎分多种类型，病因各异）、男性生殖系统先天性畸形（隐睾是睾丸未正常下降，病因与胚胎发育等有关；尿道下裂是尿道和外生殖器畸形，病因与雄激素水平、遗传等有关）。
勃起功能障碍（ED）：指阴茎持续不能达到或维持足够的勃起以完成满意性生活，病因多样，包括心理因素（如焦虑、抑郁等情绪问题）、器质性因素（如血管性疾病、神经性疾病、内分泌疾病等）。心理因素可能与长期精神压力大、夫妻关系不和谐等有关；器质性因素中，血管性因素常见如动脉粥样硬化导致阴茎动脉血流减少，神经性因素可见于脊髓损伤、帕金森病等患者。
早泄：指射精潜伏期短，通常小于3分钟，阴茎在插入阴道之前、过程中或插入后不久即射精，可由心理因素（如紧张、焦虑、过度兴奋等）、器质性因素（如前列腺炎、尿道炎等泌尿生殖系统疾病）引起，心理因素可能源于首次性生活不顺利、对性知识的误解等，器质性因素则是相关疾病影响了射精控制功能。
阴茎异常勃起
指与性欲无关的阴茎持续勃起状态，分为缺血性和非缺血性。缺血性阴茎异常勃起多由血液黏稠度增高（如白血病、镰状细胞贫血）、药物（如抗抑郁药、抗高血压药等）等引起，导致阴茎海绵体静脉回流受阻；非缺血性阴茎异常勃起相对少见，可能与阴茎海绵体平滑肌功能异常等有关。
男性不育症
指夫妇同居1年以上，未采取避孕措施，由于男方原因造成女方不孕。病因包括精液异常（如少精子症、弱精子症、无精子症、畸形精子症等），其中少精子症可能与精索静脉曲张、内分泌紊乱（如睾酮水平低下）、感染（如附睾炎、前列腺炎等）等有关；附属性腺异常（如附睾炎、精囊炎等）会影响精液的质量和输送；免疫因素（如抗精子抗体阳性）会导致精子被自身免疫系统攻击；性功能障碍（如勃起功能障碍、早泄等）可能影响精子进入女性生殖道等。
男性生殖系统感染性疾病
附睾炎：分为急性附睾炎和慢性附睾炎。急性附睾炎多由大肠杆菌、葡萄球菌等细菌感染引起，常继发于尿道炎、前列腺炎等，性生活不规律、长时间久坐等可能增加发病风险；慢性附睾炎可由急性附睾炎迁延不愈所致，也可无明显急性发作史，局部会有隐痛、坠胀感等。
前列腺炎：分为急性细菌性前列腺炎、慢性细菌性前列腺炎、慢性盆腔疼痛综合征和无症状性前列腺炎。急性细菌性前列腺炎多由细菌经尿道逆行感染引起，如尿道器械检查、导尿等操作可能导致感染；慢性细菌性前列腺炎则是细菌反复感染前列腺；慢性盆腔疼痛综合征病因复杂，可能与盆底肌肉功能失调、免疫因素等有关；无症状性前列腺炎多在体检时发现。
男性生殖系统先天性畸形
隐睾：指睾丸未能按正常发育过程从腰部腹膜后下降至阴囊，可分为单侧隐睾和双侧隐睾。病因可能与胚胎发育过程中睾丸引带异常、激素分泌不足等有关，单侧隐睾可能影响患侧睾丸的生精功能和内分泌功能，双侧隐睾如不及时治疗会导致不育，还增加睾丸恶性肿瘤的发病风险。
尿道下裂：是常见的男性尿道和外生殖器畸形，尿道开口不在阴茎头顶端，而位于阴茎腹侧、阴囊或会阴部等部位。病因与胚胎发育时期雄激素水平异常、遗传因素等有关，会影响排尿和性功能，还可能对患者的心理产生影响。
