尼帕病毒感染的影像学检查有头颅磁共振成像（MRI）、胸部X线检查、头颅CT检查等。
1.头颅磁共振成像（MRI）
是诊断尼帕病毒脑炎的首选方法。MRI可早期发现脑实质周边、基底池周围、脑干等部位的多发小灶性病变，直径2-7mm，呈圆形或条状，T1WI及FLAIR序列呈高信号，病变周围无水肿。复发和迟发性脑炎在MRI上皮质区可出现明显融合病变。
2.胸部X线检查
可见肺部轻度间质性炎症阴影，肺纹理粗糙，延伸至肺外带，无大片状模糊阴影，类似非典型肺炎性病灶，心影轻度扩大。
3.头颅CT检查
虽对早期或轻微病变的检出率较低，但能显示脑水肿或出血等严重并发症，辅助评估病情严重程度。
