扁平疣与寻常疣均由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，但二者致病亚型、临床表现、好发部位及传染性存在差异，具体区别如下：
一、病因差异
扁平疣主要由HPV3型、10型、28型等低危型病毒感染所致；寻常疣多由HPV2型、4型、7型等亚型引发，病毒通过皮肤微小破损侵入表皮细胞，刺激角质形成细胞异常增殖。
二、临床表现
扁平疣为扁平隆起性丘疹，直径2-5mm，表面光滑、肤色或淡褐色，边界清晰，搔抓后易沿抓痕呈串珠状扩散（“同形反应”）；寻常疣表现为粗糙、隆起的乳头状增生，表面呈“菜花状”或“刺状”，质地较硬，颜色与正常皮肤相近或呈灰白色。
三、好发部位
扁平疣好发于面部、手背、前臂等暴露部位，常对称分布，女性及青少年多见；寻常疣多见于手部（尤其手指）、足部（跖疣为足部寻常疣）及易受外伤部位，可单发或多发，俗称“刺猴”。
四、传染性特点
二者均通过直接接触或污染物间接传播。扁平疣因病毒扩散性强，搔抓后易形成自身接种，导致皮疹沿接触方向增多；寻常疣传染性相对较弱，自身接种范围局限，需皮肤破损后接触病毒才可能感染他人。
五、治疗与特殊人群注意事项
治疗以物理疗法（冷冻、激光、电灼）及外用药物（维A酸乳膏、水杨酸软膏、干扰素凝胶）为主。特殊人群如孕妇、哺乳期女性、糖尿病患者及免疫功能低下者，需在皮肤科医生指导下选择温和方案，避免药物刺激或病毒扩散。
