婴儿奶粉蛋白不耐受（以牛奶蛋白过敏为主）表现为摄入含牛奶蛋白奶粉后数小时至数天内出现的多系统症状，核心表现为胃肠道不适、皮肤异常及呼吸道反应，严重时可引发全身过敏。
胃肠道症状：摄入奶粉后1-2小时内出现频繁呕吐（非喷射性为主），大便呈稀水状或黏液样，严重时带血丝或黏液，伴随腹胀、持续哭闹、拒奶，长期可导致体重增长缓慢或营养不良。有过敏体质家族史或湿疹史的婴儿症状更明显，且长期可影响营养吸收，导致生长发育滞后。
皮肤症状：多见于摄入奶粉后数小时至数天，表现为特应性皮炎（婴儿湿疹），面部、头皮或躯干出现红斑、密集小丘疹，伴随剧烈瘙痒，抓挠后易破溃；或出现荨麻疹（大小不等风团，边界清晰，消退快但易反复），严重时眼睑、口唇等部位出现血管性水肿。早产儿皮肤屏障功能较弱，更易出现血管性水肿，需加强皮肤护理。
呼吸道症状：部分婴儿出现非感染性鼻塞、流涕，伴随频繁打喷嚏；或表现为持续性干咳、喘息（尤其在运动或接触过敏原后加重），严重时可出现喉头水肿，表现为声音嘶哑、吸气性呼吸困难，需紧急处理。合并鼻炎或哮喘病史的婴儿，呼吸道症状可能与原有疾病叠加，加重喘息。
全身反应：部分婴儿因长期不适出现持续哭闹、精神萎靡，喂养时频繁中断导致睡眠不足；严重过敏反应（过敏性休克）虽罕见，但可表现为血压下降、心率加快、四肢湿冷、意识模糊，需立即就医。喂养困难导致睡眠不足的婴儿，免疫力下降，可能诱发更频繁过敏反应。
