甲状腺功能减退的主要原因包括自身免疫性甲状腺损伤、甲状腺手术切除或放射性碘治疗后甲状腺组织破坏、碘摄入不足或过量、慢性甲状腺炎症（如桥本甲状腺炎）及垂体功能异常导致促甲状腺激素分泌不足。
- 自身免疫性甲状腺疾病：最常见，如桥本甲状腺炎，自身抗体攻击甲状腺组织，导致甲状腺激素合成减少。多见于30~50岁女性，有自身免疫疾病家族史者风险更高。
- 甲状腺手术或放射性碘治疗：甲状腺全切或次全切术后，剩余甲状腺组织无法满足激素需求；甲亢患者接受放射性碘治疗后，甲状腺组织受损，易引发甲减。
- 碘摄入异常：长期碘缺乏地区人群因甲状腺激素合成原料不足导致甲减；过量碘摄入也可能诱发甲状腺自身免疫反应，尤其对桥本甲状腺炎患者。
- 慢性甲状腺炎症：如淋巴细胞性甲状腺炎，炎症细胞浸润甲状腺，逐渐破坏甲状腺滤泡细胞，导致激素分泌减少。
- 垂体功能异常：垂体病变（如垂体瘤、席汉综合征）导致促甲状腺激素分泌不足，间接影响甲状腺功能。
