瑞氏综合症的并发症主要包括神经系统、肝脏、呼吸系统及心血管系统等多系统损伤，常见急性严重并发症如脑水肿、肝衰竭、呼吸衰竭，部分患者可遗留永久性神经功能障碍。
一、神经系统并发症
瑞氏综合症常引发脑水肿，表现为颅内压升高，出现头痛、呕吐、意识障碍加重，严重时进展为脑疝，压迫脑干导致呼吸心跳骤停；部分患者可出现癫痫发作，频繁抽搐进一步加重脑缺氧损伤；约1/3幸存者可能遗留智力障碍、运动障碍、认知功能下降等永久性神经后遗症。
二、肝脏并发症
肝脏是主要受累器官，早期表现为肝脏肿大、转氨酶显著升高，随病情进展出现肝细胞坏死、脂肪变性，进展为肝功能衰竭，表现为黄疸、凝血功能障碍（如皮肤瘀斑、出血倾向），严重时发生肝性脑病（意识模糊、行为异常）。若未及时干预，肝功能衰竭可迅速进展至多器官衰竭，死亡率高达20%-40%。
三、呼吸系统并发症
由于中枢神经系统受累或代谢紊乱，患者可出现呼吸抑制、通气不足，引发低氧血症和高碳酸血症，严重时进展为呼吸衰竭，需机械通气支持；部分患者因脑损伤或感染引发肺水肿，进一步加重呼吸负担；长期缺氧可能导致肺功能受损，增加肺部感染风险。
四、心血管系统并发症
心肌细胞受累可导致心肌水肿、收缩力下降，表现为低血压、心律失常（如心动过缓或早搏）；病情进展时可能出现心功能障碍，严重时引发感染性休克或心源性休克；部分患者因缺氧和代谢紊乱诱发心肌细胞坏死，增加心脏骤停风险。
五、多器官与其他系统并发症
肝脏、肾脏等多器官功能同时受损可引发多器官功能障碍综合征（MODS）；常见电解质紊乱如低血糖、低钠血症，加重神经损伤；部分患者因肾功能灌注不足出现急性肾小管坏死，表现为少尿或无尿；儿童患者若在疾病早期未得到控制，其生长发育可能受长期营养障碍和代谢紊乱影响。
