玛卡可能有对神经系统、消化系统、内分泌系统、心血管系统的影响及过敏反应，孕妇、哺乳期女性、儿童不建议服用，患有基础疾病及正在服用其他药物的人群服用前应咨询医生。
对神经系统的影响：部分人服用玛卡后可能出现神经系统方面的反应，如头痛、头晕等。有研究表明，个体对玛卡中的某些成分敏感性不同，一些人在摄入玛卡后，神经系统受到刺激，从而引发头痛等不适症状。
对消化系统的影响：可能引起胃肠道不适，像恶心、呕吐、腹痛、腹泻等。玛卡中的某些成分可能会刺激胃肠道黏膜，影响胃肠道的正常消化和吸收功能，不同体质的人对这种刺激的反应程度有所差异。例如，本身胃肠道功能较弱的人，服用玛卡后更易出现消化系统的不适。
对内分泌系统的影响：玛卡可能会干扰内分泌系统的平衡。有研究发现，长期或过量服用玛卡可能影响激素水平，尤其是对性激素水平可能产生一定的波动影响。对于本身内分泌系统存在问题的人群，如患有甲状腺疾病等，服用玛卡可能会加重病情或导致内分泌紊乱加重。
对心血管系统的影响：可能对心血管系统有一定影响，如引起血压波动、心跳加快等。玛卡中的成分可能会作用于心血管系统，影响血管的收缩和舒张以及心脏的节律。有心血管疾病病史的人群，服用玛卡需要格外谨慎，因为可能会诱发心血管方面的不良事件。
过敏反应：少数人可能对玛卡过敏，出现皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等过敏症状。过敏反应的发生与个体的过敏体质有关，不同过敏原接触史的人对玛卡过敏的概率不同。如果有明确的食物或其他物质过敏史，服用玛卡前需格外警惕过敏情况的发生。
特殊人群需特别注意
孕妇和哺乳期女性：目前关于玛卡对孕妇和哺乳期女性及胎儿、婴儿的安全性研究尚不充分，为避免可能存在的未知风险，孕妇和哺乳期女性不建议服用玛卡。
儿童：由于儿童身体各系统发育尚未成熟，玛卡对儿童的影响不明确，所以不建议儿童服用玛卡。
患有基础疾病的人群：如患有糖尿病、高血压、心脏病等慢性疾病的人群，服用玛卡可能会与正在服用的药物产生相互作用，或者影响基础疾病的控制，这类人群在考虑服用玛卡前应咨询医生的意见，由医生评估服用玛卡的风险和收益后再做决定。
正在服用其他药物的人群：玛卡可能与一些药物发生相互作用，影响药物的疗效或增加不良反应的发生风险。例如，玛卡可能与降压药、降糖药等产生相互作用，所以正在服用其他药物的人群在服用玛卡前，应告知医生正在服用的药物，由医生判断是否存在药物相互作用的风险。
