新生儿黄疸分为生理性和病理性，生理性通常7-10天自行消退，无显著危害；病理性黄疸若未及时干预，可能损伤神经系统、加重原发病或导致核黄疸等严重后果。
病理性黄疸核心危害是未结合胆红素（间接胆红素）过高，因新生儿血脑屏障发育不完善，胆红素易透过屏障沉积于神经核团（如基底核、丘脑），引发胆红素脑病（核黄疸）。临床表现为嗜睡、拒乳、角弓反张，严重时可致永久性神经损伤，如听力障碍、智力低下、运动障碍。
黄疸常为严重疾病的信号：新生儿溶血病（ABO/Rh血型不合）引发的黄疸，因大量红细胞破坏可导致贫血、心力衰竭；胆道闭锁导致的梗阻性黄疸，若不手术治疗，1岁内多进展为肝硬化、肝功能衰竭。
早产儿及高危儿风险更高：早产儿血脑屏障更薄弱，胆红素浓度达5-6mg/dl即可诱发核黄疸；低体重儿、有窒息史或感染的新生儿代谢能力差，更易因胆红素代谢缓慢出现高胆红素血症。
即使早期干预，部分患儿仍可能遗留永久性神经功能障碍，如手足徐动、听力丧失、智能发育迟缓，此类损伤不可逆，需长期康复支持。严重黄疸还可累及多系统：肝脏代谢障碍致凝血因子合成不足（出血倾向）；肾脏损伤引发肾小管功能异常（蛋白尿）；心脏负荷加重可能诱发心律失常或心力衰竭。
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